【发布时间】:2019-03-05 14:52:33
【问题描述】:
我是 sql/redshift 的新手,正在寻找合并到表的最佳方法。
我有一个红移的大(ish)表(大约 2k 列乘 50k 行)。该表有一个日期时间排序键。我将 sortkey 和其他 1 列迭代地拉入 python/pandas 数据框中,执行一些(相当复杂的)操作来生成新列。然后我将这个 pandas 数据框转换为另一个 redshift 表,我想将它与原始表合并,以便只附加新列(尽管如果整个事情被更新并不重要)。两个表都有相同的排序键,这应该很简单吧?只是基本上添加了一些新列? (请原谅我的幼稚)
表1
datetime, rainfall, windspeed, cloudcover
2000-01-01,5,5,5
2000-01-02,7,5,5
2000-01-03,1,5,5
2000-01-04,0,5,5
pandasdf1
datetime, rainfall, rainfall_movingAverage, other_calculation
2000-01-01,5,5,NaN
2000-01-02,7,6,4.56
2000-01-03,1,4.3,7.53
2000-01-04,0,3.75,3.55
这是我想要实现的目标:
datetime, rainfall, windspeed, cloudcover,rainfall_movingAverage, other_calculation
2000-01-01,5,5,5,5,NaN
2000-01-02,7,5,5,6,4.56
2000-01-03,1,5,5,4.3,7.53
2000-01-04,0,5,5,3.75,3.55
在 pandas 中,这非常简单,可以通过多种方式完成,其中一种方式是:
result = pd.concat([table1, pandasdf1], axis=1, sort=True)
但是,数据框的大小正在使 pandas 崩溃,并且数据会变得比现在大得多,因此我不得不将其迁移到 redshift。我尝试使用此命令进行合并:
SELECT * FROM table1
FULL OUTER JOIN pandasdf ON (table1.datetime = pandasdf.datetime)
这似乎有效(至少不会崩溃或返回错误),但原始表未更新。我似乎找不到额外的语法来更新原始表。请注意,我正在使用 python sql 引擎与 redshift 进行交互
import psycopg2
SQL="""
SELECT * FROM table1
FULL OUTER JOIN pandasdf ON (table1.datetime = pandasdf.datetime)
"""
def merge_redshift_tables(SQL):
"""merge the left and right tables"""
success=False
try:
conn=None
"""Establish a connection to redshift"""
conn=psycopg2.connect(dbname= 'mydb', host='myIP', port= 'myport', user= 'myusername', password= 'mypassword')
"""make a cursor object"""
cur = conn.cursor()
cur.execute(SQL)
success=True
except psycopg2.Error as e:
print(e)
finally:
if conn is not None:
conn.close()
return success
如果有人可以帮助我完成这一步,那将是很好的第一步。但是,我不确定这是否是对大约 2000 列中的每一列执行此类操作的最佳方法,因此如果有人可以分享一些关于最佳实践的智慧,那么我也将非常感激。我大致计划将工作分布在多个并行工作的计算节点上,但这取决于红移平滑合并所有这些新列的能力(我知道这可能是一个问题)。非常欢迎任何有关该领域最佳实践的建议。
非常感谢
##### 编辑以下似乎运行没有错误,表明已成功创建具有所需列的新表:
SELECT t1.*, t2.new_col
INTO TABLE combined FROM table1 t1
LEFT JOIN pandasdf1 t2 ON t1.datetime = t2.datetime;
但是当我查询它返回一个错误提示没有新表:
def get_col(table, col='*'):
"""Gets all data from a column from a table"""
coldata=None
try:
conn=None
"""Establish a connection to redshift"""
conn=psycopg2.connect(dbname= 'mydb', host='myIP', port= 'myport', user= 'myusername', password= 'mypassword')
coldata = pd.read_sql("select {} FROM {}".format(col, table), conn).set_index('gmt_reportedtime').dropna()
except psycopg2.Error as e:
print(e)
finally:
if conn is not None:
conn.close()
return coldata
check = get_col('combined')
返回:
pandas.io.sql.DatabaseError: Execution failed on sql 'select * FROM combined': relation "combined" does not exist
编辑
我现在已经解决了这个问题!使用 python 语句需要提交更改:
conn.commit()
【问题讨论】:
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为什么有这么多列?您可以/应该将列转换为行吗?
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它只是数据的大小,只是为了提供一些背景知识,我更习惯于使用数据框而不是数据库,我感觉它们彼此根本不同?
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不是从根本上说,但通常会标准化表格,尤其是当您有 col1 col2 col3 col4 等时 - 您将创建一个新列并进行数据透视
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你能解释一下你所说的标准化是什么意思吗?
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你能分享一下你桌子上列的名字吗?我可以以此为例。
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