无效的 mex 文件，libarmadillo，无法打开共享对象文件答案

【问题标题】：Invalid mex-file, libarmadillo, cannot open shared object file无效的 mex 文件，libarmadillo，无法打开共享对象文件
【发布时间】：2015-02-09 10:59:16
【问题描述】：

我知道有很多关于这个主题的帖子，这可能是重复的，但我不这么认为。我的配置是：Matlab R2014b，clang 3.4，Ubuntu 14.04，armadillo-4.600.4。

我有一个本地安装的犰狳（不是系统方面的，所以手动包括/链接），在 Matlab 之外可以正常工作。我正在尝试使用 Matlab 中的 Armadillo 运行 Mex 文件。使用命令（简称截断）可以很好地编译：

mex -compatibleArrayDims -outdir +mx -L/home/john/.local/arma/lib -larmadillo -I/home/john/.local/arma/include test_arma.cpp

问题是当我尝试运行它时出现此错误：

Error using mx.test_arma
Invalid MEX-file '/path/to/+mx/test_arma.mexa64': libarmadillo.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory

从启动 Matlab 的 shell 中回显的环境变量 LD_LIBRARY_PATH 包含 /home/john/.local/arma/lib（其中 libarmadillo.so 是），我还使用 setenv('LD_LIBRARY_PATH',...) 在 Matlab 中手动添加了此路径。我有什么遗漏吗？

【问题讨论】：

我现在没有链接，但 MATLAB 对LD_LIBRARY_PATH 很感兴趣。也许先尝试一个符号链接。另外，您确定添加到路径的依赖项是 64 位的。我不知道 Ubuntu 的文件夹结构。
@chappjc 您对 64 位的评论很有趣，我将仔细检查所有内容，并从头开始重新编译我的共享库以确保没有不匹配，因为正如我所说的那样现在得到段错误，我相当有信心它不是来自代码本身。

标签： matlab shared-libraries mex armadillo

【解决方案1】：

所以我发现了如何运行它。现在是段错误：/ 而且我相当有信心这不是代码本身，因为我可以在 Matlab 之外编译和运行完全相同的代码。我会尝试找出问题所在，如果相关，我稍后会在这里发布我的冒险经历。

对于running问题；似乎 Matlab 使用变量 LD_RUN_PATH 在运行时加载共享库。在我的情况下，使用setenv 将我的路径... /.local/arma/lib 附加到LD_RUN_PATH 就可以了。为您的 cmets/答案干杯！

更新：我终于解决了这个问题，问题是由于 Matlab 的 BLAS/LAPACK 库之间的预期字长不匹配（32/64 位，即int32_t 与int64_t）和犰狳的叫声。我发布了两个解决方案here。

【讨论】：

啊！我必须最终记住LD_RUN_PATH 变量。我知道 MATLAB 环境有些不同，但我很少使用 Linux...+1 BTW，为什么-compatibleArrayDims？
@chappjc Matlab 的新版本默认为 mex 启用 -largeArrayDims（或类似的东西），它本质上将 mwSize 定义为 uint64_t。我正在使用我自己的库，它本身使用 Armadillo，我现在一直在使用uint32_t。 compatibleArrayDims 只是一种恢复“旧方式”的方法，并使 Matlab 使用 32 位而不是 64 位进行索引:) （请注意：这可能是我的段错误的原因，如果由于某种原因这也会导致墨西哥期待 32 位库..)
所以你使用无符号的 32 位索引，明白了。但我认为你的意思是 unsigned long long 是 64 位。 ;)
啊，你太快了 :) 是的，我刚刚更正了，非常感谢！