【问题标题】:C++ Armadillo and OpenMp: Parallelization of summation of outer products - define reduction for Armadillo matrixC++ Armadillo 和 OpenMp:外积求和的并行化 - 定义 Armadillo 矩阵的约简
【发布时间】:2017-07-09 05:32:31
【问题描述】:

我正在尝试使用对犰狳矩阵求和的 OpenMP 并行化 for 循环。我有以下代码:

#include <armadillo>
#include <omp.h>

int main()
{

        arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
        arma::mat X = arma::zeros(700,700);
        arma::rowvec point = A.row(0);

        # pragma omp parallel for shared(A) reduction(+:X)
        for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++){
                arma::rowvec diff = point - A.row(i);
                X += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
        }

}

我收到此错误:

[Legendre@localhost ~]$ g++ test2.cpp -o test2 -O2 -larmadillo -fopenmp
test2.cpp: In function ‘int main()’:
test2.cpp:11:52: error: user defined reduction not found for ‘X’

我阅读了有关定义约简的内容,但我还没有找到使用犰狳矩阵的示例。在我的案例中,定义犰狳矩阵减少的最佳方法是什么?

【问题讨论】:

    标签: c++ openmp armadillo


    【解决方案1】:

    这些缩减仅适用于内置类型(doubleint 等)。因此,您必须自己进行还原,这很简单。只需将每个线程的结果累积在一个线程局部变量中,然后将其添加到临界区中的全局结果中。

    #include <armadillo>
    #include <omp.h>
    
    int main()
    {
    
      arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
      arma::mat X = arma::zeros(700,700);
      arma::rowvec point = A.row(0);
    
      #pragma omp parallel shared(A)
      {
        arma::mat X_local = arma::zeros(700,700);
    
        #pragma omp for
        for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++)
        {
          arma::rowvec diff = point - A.row(i);
          X_local += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
        }
    
        #pragma omp critical
        X += X_local;
      }
    }
    

    使用更新的 OpenMP(我认为是 4.5?),您还可以为您的类型声明用户定义的归约。

    #include <armadillo>
    #include <omp.h>
    
    #pragma omp declare reduction( + : arma::mat : omp_out += omp_in ) \
      initializer( omp_priv = omp_orig )
    
    int main()
    {
    
      arma::mat A = arma::randu<arma::mat>(1000,700);
      arma::mat X = arma::zeros(700,700);
      arma::rowvec point = A.row(0);
    
      #pragma omp parallel shared(A) reduction(+:X)
      for(unsigned int i = 0; i < A.n_rows; i++)
      {
        arma::rowvec diff = point - A.row(i);
        X += diff.t() * diff; // Adding the matrices to X here
      }
    }
    

    【讨论】:

    • 谢谢。为什么在添加到 X_local 之前不需要关键子句?我也尝试了第二个答案,它给了我这个错误(我知道我的矩阵的尺寸没有问题):error: addition: incompatible matrix dimensions: 0x0 and 700x700 terminate called after throwing an instance of 'std::logic_error' what(): addition: incompatible matrix dimensions: 0x0 and 700x700 terminate called recursively Aborted (core dumped)
    • @Cauchy (1) X_local 对于每个线程都是本地的。指令 #pragma omp for 将 for 循环拆分为每个线程的分区,因此没有两个线程写入同一个 X_local。 (2) 是的,这是一个错误。我忘记了初始化程序,矩阵默认初始化为 0x0。查看更新后的答案。
    • @Cauchy 默认情况下,外部作用域中的所有变量都作为共享进入并行区域(循环变量除外),因此您不必显式标记任何共享。
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