【发布时间】:2019-08-10 16:16:52
【问题描述】:
我正在尝试解决http://rosalind.info/problems/list-view/ 的问题,其中有一个称为 IPRB 的问题。简而言之,我们有 3 种不同的生物体 k(纯合子显性)、m(杂合子)和 n(纯合子隐性)。它要求您计算两个随机选择的个体的后代具有显性等位基因的概率。您可以从这里查看 (http://rosalind.info/problems/iprb/)。
我的问题是;我用示例输入(2、2、2 表示 k、m、n)编写了一个工作代码,并得到了估计的输出。但是,当输入值彼此不同(即 25、20、18)时,我收到如下错误消息:
Traceback(最近一次调用最后一次): 文件“C:/Users/mNm/PycharmProjects/PySummer/venv/Scripts/IPRB.py”,第 43 行,在 pr3 = 浮动(pr31 + pr32 + pr33) NameError: 名称 'pr31' 未定义
我已经在网上研究了该代码的原因。似乎此错误与名称定义有关,例如使用后定义或功能外定义等。但是我检查时没有任何名称。总之,我不知道如何解决它,我决定在这里问。
k = 2
m = 2
n = 2
whole = k + m + n
org = [k, m, n]
我有 3 个变量和一个保存它们的列表。输入工作正常,但是......
例如当它是这样的:
k = 25
m = 25
n = 19
whole = k + m + n
org = [k, m, n]
我得到错误:
Traceback(最近一次调用最后一次): 文件“C:/Users/mNm/PycharmProjects/PySummer/venv/Scripts/IPRB.py”,第 43 行,在 pr3 = 浮动(pr31 + pr32 + pr33) NameError: 名称 'pr31' 未定义
第 43 行在这里:
if i == n:
n_start = float(n / whole)
for j in org:
if j == k:
pr31 = float(n_start * (k / (whole - 1)))
if j == m:
pr32 = float(n_start * (m / (whole - 1)) * 0.5)
if j == n:
pr33 = float(n_start * ((n - 1) / (whole - 1)) * 0)
43 --> pr3 = float(pr31 + pr32 + pr33)
如果您想查看整个内容并进行检查,我也想粘贴我的完整代码。
k = 2
m = 2
n = 2
whole = k + m + n
org = [k, m, n]
for i in org:
if i == k:
k_start = float(k/whole)
for j in org:
if j == k:
pr11 = float(k_start * ((k - 1) / (whole - 1)))
if j == m:
pr12 = float(k_start * (m / (whole - 1)))
if j == n:
pr13 = float(k_start * (n / (whole - 1)))
pr1 = float(pr11 + pr12 + pr13)
if i == m:
m_start = float(m/whole)
for j in org:
if j == k:
pr21 = float(m_start * (k / (whole - 1)))
if j == m:
pr22 = float(m_start * ((m - 1) / (whole - 1)) * 0.75)
if j == n:
pr23 = float(m_start * (n / (whole - 1)) * 0.5)
pr2 = float(pr21 + pr22 + pr23)
if i == n:
n_start = float(n / whole)
for j in org:
if j == k:
pr31 = float(n_start * (k / (whole - 1)))
if j == m:
pr32 = float(n_start * (m / (whole - 1)) * 0.5)
if j == n:
pr33 = float(n_start * ((n - 1) / (whole - 1)) * 0)
pr3 = float(pr31 + pr32 + pr33)
dom_pr = float(pr1 + pr2 + pr3)
print(dom_pr)
我希望输出介于 0-1 之间,因为这是一个概率,但更重要的是了解导致该错误的原因以及我做错了什么。
【问题讨论】:
-
例如,
p21、p22和p23当且仅当i == m时才定义,对吗?然而,pr2 = float(pr21 + pr22 + pr23)在任何情况下都是计算出来的,即使在i != m时也是如此。那么,当您尝试添加一些...不存在的变量时会发生什么?一个`NameError`。 -
这实际上是正确的。我是新手,所以我错过了这一点。非常感谢。如果您将其写为答案,我会检查它是否为正确答案。
标签: python-3.x bioinformatics nameerror rosalind