python subprocess.call() 在这个程序的 Sublime Text 2 中失败答案

【问题标题】：python subprocess.call() fails in Sublime Text 2 on this programpython subprocess.call() 在这个程序的 Sublime Text 2 中失败
【发布时间】：2014-05-01 17:08:10
【问题描述】：

几个小时以来，我一直被一个奇怪的错误困住，在 Google 中搜索解决方案并失败了，可能是因为问题非常具体，但它实际上具有更广泛的含义，这就是我一直在努力修复的原因它。

我正在使用 Python 2.6 并且可以使用subprocess.call() 在普通 Python 终端甚至 iPython 终端中运行名为 STAMP 的程序：

>>>Import subprocess
>>>subprocess.call('stamp')

这很好，但是当我通过 sublime text 2 (ST2) 使用它的 sublimeREPL 插件 for python 或 iPython (Tools>sublimeREPL> 执行相同的事情时Python>...) 它失败并出现以下错误：

> Traceback (most recent call last):   File "<stdin>", line 1, in
> <module>   File "<string>", line 27, in <module>   File
> "/usr/lib64/python2.6/subprocess.py", line 478, in call
>     p = Popen(*popenargs, **kwargs)   File "/usr/lib64/python2.6/subprocess.py", line 642, in __init__
>     errread, errwrite)   File "/usr/lib64/python2.6/subprocess.py", line 1234, in _execute_child
>     raise child_exception OSError: [Errno 2] No such file or directory

当您调用系统上未安装的程序时，它给出的错误相同。似乎自相矛盾的是，除了“stamp”之外，我测试过的任何其他已安装程序/命令都没有出现此错误（因此您会认为 sublimeREPL 工作正常），但运行 subprocess.call('stamp') 确实有效在本机 python 终端以及 iPython 中（所以你会认为 stamp 工作/安装正常）。我想到的唯一线索是我必须使用 g++ 安装 stamp

总结：

subprocess.call('stamp') 在原生 python 终端中工作
subprocess.call('stamp') 在 ST2 的 sublimeREPL python 终端中不起作用
subprocess.call() 似乎在 sublimeREPL 或本机 python 终端中都可以正常工作

额外信息：

Python 2.6.3
印章安装步骤：

第 1 步：安装 GNU 科学库。从http://www.gnu.org/software/gsl/下载将“include”和“lib”目录添加到 PATH。

第 2 步：编译 STAMP 代码。使用如下命令：
        g++ -O3 -o stamp Motif.cpp Alignment.cpp ColumnComp.cpp \
            PlatformSupport.cpp PlatformTesting.cpp Tree.cpp \
            NeuralTree.cpp MultipleAlignment.cpp RandPSSMGen.cpp \
            ProteinDomains.cpp main.cpp -lm -lgsl -lgslcblas

    Note: if the GSL library is not in the PATH, add the appropriate
    directories using the -L and -I compiler options.
第 3 步：测试一下！

【问题讨论】：

PATH 可能未在 sublimeREPL 终端内设置。使用完整路径来标记（可能是 /usr/bin/stamp 或 /usr/local/bin/stamp）有效吗？
@dano，stamp 的代码存储在/home/ab108/software/STAMP.v1.2/code/ 中，并按照使用 g++ 的说明进行操作，似乎在使用 GNU 编译后，它将代码与别名 stamp 相关联，并且我已添加到路径，带有export PATH=$PATH:/home/ab108/software/STAMP.v1.2/code/。运行subprocess.call('/home/ab108/software/STAMP.v1.2/code/') 时，我得到：OSError: [Errno 13] Permission denied
你想要subprocess.call('/home/ab108/software/STAMP.v1.2/code/stamp')
成功了！！太感谢了！并感谢您在第一条评论中的解释

标签： python g++ sublimetext2 python-2.6 sublime-text-plugin

【解决方案1】：

将我的评论转换为答案形式，以便更清楚地解决问题：

路径未在 sublimeREPL 终端内设置。如果您提供戳记可执行文件的完整路径，subprocess.call 将正常工作。

【讨论】：