Matplotlib 隐藏在体素后面的散点图答案

【问题标题】：Matplotlib hiding scatters behind voxelsMatplotlib 隐藏在体素后面的散点图
【发布时间】：2019-10-01 09:02:14
【问题描述】：

我正在尝试可视化一个 3D 参数空间，在该空间中我对带有体素的参数充满信心，并且我的估计参数带有散点图。目标是清楚地看到参数是否在这个空间内。

即使体素不是透明的，散点图也会绘制在体素的“顶部”：

我希望体素至少将散射体隐藏在其后面，但最好我想让体素透明（例如 alpha 0.5），散射体根据光线穿过的体素改变颜色.使用 matplotlib 可以实现这样的事情吗？

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D


x, y, z = np.random.random((3, 100)) * 5

fig = plt.figure()
ax = fig.gca(projection='3d')

ax.scatter(x, y, z)

cube = np.mgrid[0:1:0.2,0:1:0.2] > 0.5
ax.voxels(cube, edgecolor='k', linewidth=0.)

【问题讨论】：

这是 matplotlib 3D 绘图的一个已知问题。见这里：matplotlib.org/mpl_toolkits/mplot3d/… 建议尝试使用 mayavi 代替
@tmdavison，谢谢，我不知道。那我就搬到 Mayavi。

标签： python matplotlib voxel

【解决方案1】：

正如@tmdavison 指出的那样，matplotlib 对于这类事情非常有限。这是我使用 mayavi 代替的示例。

import mayavi.mlab
import np as np


x, y, z = np.random.random((3, 100)) * 5
xx, yy, zz = np.where(np.mgrid[0:1:0.2,0:1:0.2] > 0.5)

nodes = mayavi.mlab.points3d(x, y, z,
                             color=(1, 0, 0),
                             scale_factor=0.1)

mayavi.mlab.points3d(xx, yy, zz,
                     mode="cube",
                     color=(0, 1, 0),
                     scale_factor=1)

mayavi.mlab.show()

【讨论】：