在 R 中调试 roxygen2 的 roxygenize答案

【问题标题】：Debugging roxygen2's roxygenize in R在 R 中调试 roxygen2 的 roxygenize
【发布时间】：2014-02-02 01:15:10
【问题描述】：

在 R 中从 roxygen2 包运行 roxygenize() 命令时，我收到消息：

Error in get(fun, mode = "function", envir = parent.frame()) : 
  object '22' of mode 'function' was not found

任何如何调试此消息的想法将不胜感激。我已经尝试将我的包裹 grepping 为“22”，但没有出现任何相关信息。 Traceback 也无济于事（通过 roxygen2 函数而不是我的包提供回溯）：

6: get(fun, mode = "function", envir = parent.frame())
5: formals(partitum$object$value)
4: roclet_rd_one(partitum, base_path)
3: roc_process.had(roc, parsed, base_path, options = options)
2: roc_process(roc, parsed, base_path, options = options)
1: roxygenize("myPackage")

任何建议都非常感谢 - 谢谢。

【问题讨论】：

如果无法访问包（github 等），这很困难。我一次提取了一半的函数，并进行了氧化并添加或减去了一半，直到我找到了冒犯的函数，然后在某个地方寻找一些你看过的愚蠢的东西。
看我的回答。你可以记录变量，你只需要做一些不同的事情。

标签： r roxygen2

【解决方案1】：

发现了问题 - 我有关于几个变量（不是函数）的 roxygen 文档。我删除了针对它起作用的变量的文档（我只有两个）。

过去记录变量对我有用，但我认为自从更新到 roxygen 3.0.0 后它可能已损坏。我会把它报告给维护者，看看他们是怎么做的。谢谢！

【讨论】：

【解决方案2】：

我也遇到了这个错误。问题是 roxygen 不希望您的数据文档与您的数据定义一起出现。如果您提供非 NULL 值，roxygen 会将其视为要记录的函数。

代替：

#' Data title
#' 
#' More information
#' 
#' @docType data
#' @format A data frame with some rows and some variables
my_data <- data.frame(x=rnorm(100),y=rexp(100))

你需要这个：

#' Data title
#' 
#' More information
#' 
#' @docType data
#' @format A data frame with some rows and some variables
#' @name my_data
NULL
my_data <- data.frame(x=rnorm(100),y=rexp(100))

【讨论】：