甘特式时间线图（以 R 为底）

Question

我有一个如下所示的数据框：

       person n start end
1         sam 6     0   6
2        greg 5     6  11
3     teacher 4    11  15
4         sam 4    15  19
5        greg 5    19  24
6       sally 5    24  29
7        greg 4    29  33
8         sam 3    33  36
9       sally 5    36  41
10 researcher 6    41  47
11       greg 6    47  53

其中 start 和 end 是时间或持续时间（sam speak 从 0 到 6；greg 从 6 到 11 等）。 n 是这个人说话的时长（在这种情况下是词数）。我想将其绘制为基础 R 中的时间线（我最终可能会使用 ggplot2 提出类似的问题，但这个答案是特定于基础 R [当我说基础时，我指的是标准安装附带的软件包]）。

y 轴是人，x 轴是时间。希望最终产品对于上面的数据看起来像这样：

我想使用 base R 来做这个。我不知道如何解决这个问题。我的想法是使用点图并绘制点图但忽略点。然后用方形端段检查这个。我不确定这将如何工作，因为段需要数字 x 和 y 点来制作段，并且 y 轴是分类的。另一个想法是将因子转换为数字（为每个因子分配一个数字）并绘制为空白散点图，然后使用方形端线段进行遍历。这可能是我所在领域查看语音模式的强大工具。

提前感谢您的帮助。

PS 方端线段的参数是 segments(... , lend=2) 以节省那些不熟悉所有线段参数的人查找此信息的时间。

Answer 1

你说你想要一个基本的 R 解决方案，但你没有说为什么。由于这是ggplot 中的一行代码，所以我还是展示了这一点。

library(ggplot2)
ggplot(dat, aes(colour=person)) + 
    geom_segment(aes(x=start, xend=end, y=person, yend=person), size=3) +
    xlab("Duration")

Answer 2

和@John 的做法很像，不过既然做了，我就贴出来吧：）

这是一个绘制甘特图的通用函数（无依赖关系）：

plotGantt <- function(data, res.col='resources', 
                      start.col='start', end.col='end', res.colors=rainbow(30))
{
  #slightly enlarge Y axis margin to make space for labels
  op <- par('mar')
  par(mar = op + c(0,1.2,0,0)) 

  minval <- min(data[,start.col],na.rm=T)
  maxval <- max(data[,end.col],na.rm=T)

  res.colors <- rev(res.colors)
  resources <- sort(unique(data[,res.col]),decreasing=T)

  plot(c(minval,maxval),
       c(0.5,length(resources)+0.5),
       type='n', xlab='Duration',ylab=NA,yaxt='n' )
  axis(side=2,at=1:length(resources),labels=resources,las=1)
  for(i in 1:length(resources))
  {
    yTop <- i+0.1
    yBottom <- i-0.1
    subset <- data[data[,res.col] == resources[i],]
    for(r in 1:nrow(subset))
    {
      color <- res.colors[((i-1)%%length(res.colors))+1]
      start <- subset[r,start.col]
      end <- subset[r,end.col]
      rect(start,yBottom,end,yTop,col=color)
    }
  }
  par(mar=op) # reset the plotting margins
}

使用示例：

data <- read.table(text=
'"person","n","start","end"
"sam",6,0,6
"greg",5,6,11
"teacher",4,11,15
"sam",4,15,19
"greg",5,19,24
"sally",5,24,29
"greg",4,29,33
"sam",3,33,36
"sally",5,36,41
"researcher",6,41,47
"greg",6,47,53',sep=',',header=T)

plotGantt(data, res.col='person',start.col='start',end.col='end',
          res.colors=c('green','blue','brown','red','yellow'))

结果：

Answer 3

虽然 y 轴是分类的，但您只需为类别 (1:5) 分配数字并跟踪它们。使用因子的默认 as.numeric() 通常会按字母顺序对它们进行编号，但您还是应该检查一下。使用 xaxt = 'n' 参数制作你的情节。然后使用axis()命令放入一个y轴。

axis(2, 1:5, myLabels)

请记住，无论何时您在绘制地图时，唯一的放置方式就是使用数字。分类 x 或 y 值始终只是数字 1:nCategories 用类别名称标签代替轴上的数字。

类似下面的内容让你足够接近（假设你的 data.frame 对象被称为 datf）...

datf$pNum <- as.numeric(datf$person)
plot(datf$pNum, xlim = c(0, 53), type = 'n', yaxt = 'n', xlab ='Duration (words)', ylab = 'person', main = 'Speech Duration')
axis(2, 1:5, sort(unique(datf$person)), las = 2, cex.axis = 0.75)
with(datf, segments(start, pNum, end, pNum, lwd = 3, lend=2))