【发布时间】:2018-07-02 08:58:34
【问题描述】:
代码(我目前使用的一个更简单的版本)可以在串行后端完美运行:
regis <-list()
EOFvalues <-array(,c(5,6))
EOFvaluesM <-array(,c(5,6))
for(j in 1:6) {
for(k in 1:5){
loc_no <- (j-1)+k
regis[[j]]=c(j,k)
EOFvalues[k,j]=j+k
EOFvaluesM[k,j]=j*k
}}
结果为 1:regis(a list):
2:EOFvalues(一个数组):
3:EOFvaluesM(一个数组):
但只要我使用并行后端运行它
regis <-list()
EOFvalues <-array(,c(5,6))
EOFvaluesM <-array(,c(5,6))
library(doParallel)
cores0=detectCores()
cl<-makeCluster(cores0, type= "SOCK" ,outfile="")
registerDoParallel(cl)
oper <- foreach(j=1:6, .combine='c',.export = c("%dopar%"), .packages = c("doParallel")) %dopar% {
foreach(k=1:5,.export = c("%dopar%"), .packages = c("doParallel")) %do% {
regis[[j]]=c(j,k)
EOFvalues[k,j]=j+k
EOFvaluesM[k,j]=j*k
par_res <- list(regis,EOFvalues,EOFvaluesM)
}
}
stopImplicitCluster()`
所有的结果都很混乱:
(我的意思是我没有得到串行后端给出的结果,这可能是因为我对 R 中的并行性知之甚少)。
我需要获得类似的结果才能在我的项目中继续进行并节省内存和时间(因为实际上,EOFvalues 和 EOFvaluesM 的顺序为 (324,625))。所以,我不能离开并行后端。是否可以使用此代码重新生成相同的结果?如果是,那怎么办?
【问题讨论】:
标签: r parallel-processing parallel.foreach