DICOM：将切片位置与图像方向和患者位置相关联答案

【问题标题】：DICOM: relating Slice Location to Image Orientation and Patient PositionDICOM：将切片位置与图像方向和患者位置相关联
【发布时间】：2016-10-19 17:38:10
【问题描述】：

如果图像方向（患者）标签 (0020,0037) 读取 [1,0,0,0,1,0] 并且患者位置标签 (0018, 5100) 读取 'HFS'，我如何解释 Slice位置标签（0020,1041），假设它存在？我知道它表示“以毫米为单位的图像平面的相对位置”，我只是在将范围的端点与 DICOM 参考坐标系 (RCS) 中的 Z 轴相关联时遇到了麻烦。

示例：我有一系列切片位置编号，范围为：[-1873.382, -771.782]

由于数字在增加，并且在 DICOM RCS 中，Z 轴从下到上方向增加，我可以得出结论，'-1873.382' 是最下层切片的位置吗？

另外，请注意，每个切片的图像位置（患者）(0020,0032) 属性的 z 坐标包含与切片位置标记相同的信息。

【问题讨论】：

您还需要图像位置（患者）标签 0020,0032）来订购您的堆栈。
stackoverflow.com/questions/40008507/…
@LEADTOOLSSupport 我注意到图像位置（患者）标签的 z 坐标包含与切片位置相同的信息，因此由于它不包含任何新的（相关）信息，所以我没有在我的帖子中没有提到它。但为了澄清起见，我编辑了我的帖子以添加此内容。
@kritzel_sw 谢谢 - 我在原始帖子之后阅读了这些链接中的信息，但我仍然有些困惑。我编辑了上面的帖子以添加更多信息。
@user762098：看我的回答

标签： dicom

【解决方案1】：

我仍然建议不要使用 Slice Location 属性进行排序。在 MR 成像中，切片可以具有任意方向，甚至在 CT 中，扫描架也可以倾斜，因此您不能相信所有切片都平行于 xy 平面。所以你实际上不知道切片位置指的是哪个轴。

我所做的是从两个切片中减去 ImagePositionPatient，这给了我堆栈中切片移动的方向。可以按差分向量的数量排序。

【讨论】：

这个答案是正确的。您应该减去任何两个 IPP 并归一化以获得矢量 A 但是您应该采用 IOP 的叉积来获得方向。 IOP 有两个向量 (row, col) 和 B = row x col。如果 A、B 之间的角度大于 180，则将 A 反转。A 和 B 之间的角度是 Gantry Tilt，A 是您应该用来对切片位置进行排序的轴。
DICOM 将 SliceLocation 称为“名义”值。换句话说，它在任何数学意义上都不可靠。请改用 IPP。
更正：我的意思是说“如果 A 和 B 之间的角度超过 90 度”，顺便说一句。该系列中的所有 IPP 都应该是共线的。如果他们不是那么，那么......你在 la la land。此外，如果到 IPP 之间的距离小于 1e-7（浮动 epsilon），那么您也有点搞砸了。

【解决方案2】：

Image Position (Patient) (0020, 0032) 是图像左上角的 x、y 和 z 坐标，Image Orientation (0020, 0037) 表示第一行和第一列的方向尊重患者（进一步由患者方向定义）。 X轴递增方向为向患者左侧，y轴递增方向为后侧，z轴递增方向为患者头部。

在您的情况下，如果 Z 轴发生变化并且增加朝向头部，我将使用 Z 轴值对堆栈进行排序。它比切片位置更可靠。是的，最小值（例如值 -1873.382）是最劣质的切片。

【讨论】：