我有一个带有数值的矩阵。我能够在热图中使用 heatmap.2 转换这些值。
heatmap.2(as.matrix(mtcars), Rowv=FALSE, Colv=FALSE, density.info="none", trace="none", dendrogram='none')
我现在想将热图导出为 16 位图像，其中包含所有值作为颜色代码中的信息。我的想法是用 ImageJ/Fiji 分析生成的图像。但是，我只找到了生成不同格式的 RGB 文件的导出选项，这些文件无法用于我的 ImageJ 分析。
我将非常感谢您的任何意见。非常感谢！
干杯， 罗斯
【问题讨论】：
常见的图像格式（jpeg、png、tif）通常用于标准图像（想想照片或图形）。
对于更多功能，例如 16 位编码，我们必须将它们视为栅格（用于图像处理的图像（例如您的 ImageJ）或地理信息系统）。我们将为此使用raster 和rgdal 包（tiff 格式需要后者）。
假设您的热图矩阵称为m
library(raster)
library(rgdal)
r <- raster(m) # convert your matrix to as raster (spatialized matrix)
writeRaster(r, "r.tif", type="INT2U") # INT2U stands for Unsigned 16bits Integer (?dataType for other types)
【讨论】：