如何从当前文件夹的终端运行 imageJ？答案

【问题标题】：How to run imageJ from terminal at current folder?如何从当前文件夹的终端运行 imageJ？
【发布时间】：2018-05-21 19:41:33
【问题描述】：

我需要在 macOS 上从终端运行 Fiji(imageJ) 脚本。使用下面的代码。

/Applications/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx --headless -macro ~/desktop/testing.ijm.ijm

而我需要运行的斐济脚本是

dir = getDirectory("Where I need help");
run("Image Sequence...", "open=dir");
path=dir+"needsave.avi";
run("AVI... ", "compression=JPEG frame=5 save=&path");
close();

但是我希望目录成为终端中的当前位置。例如：

MYs-MBP:~ csh;
[MYs-MBP:~] cd desktop/test/test2
[MYs-MBP:~/desktop/test/test2] /Applications/Fiji.app/Contents/MacOS/ImageJ-macosx --headless -macro ~/desktop/testing.ijm.ijm

因此我将使用我编写的斐济脚本处理 test2 中的所有内容。

【问题讨论】：

标签： terminal macros imagej fiji

【解决方案1】：

使用这个宏命令：

cwd = call("java.lang.System.getProperty", "user.dir");

请注意，此问题已交叉发布到 ImageJ 邮件列表 (1) 和 ImageJ 论坛 (2)。

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【讨论】：