【问题标题】:fiji imagej crashes on Ubuntu 16.04fiji imagej 在 Ubuntu 16.04 上崩溃
【发布时间】:2017-06-22 09:49:02
【问题描述】:

我在我的 Ubuntu 16.04 机器上安装了 fiji(imagej 的发行版),双击桌面图标打开了应用程序一秒钟,或者更确切地说,它试图打开,然后死了。我在网上找了一个答案,发现在这个页面http://imagej.1557.x6.nabble.com/Fiji-crashes-UI-on-Ubuntu-all-recent-versions-td5005603.html可以试试

./ImageJ-linux64 --dry-run 

这会打印出程序使用的运行命令。它调用系统java。所以我复制了命令,并切换到使用包含的java(fiji和imagej带有他们自己的java)并修复了它。我用命令创建了一个 shell 脚本(引用包含的 java 可执行文件),这个脚本可以启动斐济。

【问题讨论】:

    标签: ubuntu imagej fiji


    【解决方案1】:

    转到您的斐济安装文件夹(Fiji.app 或其他名称)并运行

    ./ImageJ-linux64 --dry-run
    

    这将输出一个长字符串,类似于

    java -Dpython.cachedir.skip=true -Dplugins.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Xmx3714m -Xincgc -XX:PermSize=128m -Djava.class.path=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/jars/imagej-launcher-4.0.5.jar -Dimagej.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dij.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dfiji.dir=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app -Dfiji.defaultLibPath=lib/amd64/server/libjvm.so -Dfiji.executable=./ImageJ-linux64 -Dij.executable=./ImageJ-linux64 -Djava.library.path=/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/lib/linux64:/home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/mm/linux64 net.imagej.launcher.ClassLauncher -ijjarpath jars -ijjarpath plugins net.imagej.Main
    

    将命令复制到脚本文件中,并将第一个“java”替换为包含的 java 可执行文件的完整路径,例如

    /home/pwarner/Schreibtisch/Bildanalyse/Fiji.app/java/linux-amd64/jdk1.8.0_66/jre/bin/java
    

    将文件保存在目录中(或任何你喜欢的地方)并调用它来启动斐济,类似于

    ./start_fiji.sh
    

    【讨论】:

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