根据 ImageJ 宏中的文件名结尾设置不同的阈值答案

【问题标题】：Setting different thresholds dependent on what filename ends with in ImageJ macro根据 ImageJ 宏中的文件名结尾设置不同的阈值
【发布时间】：2015-12-15 00:34:14
【问题描述】：

我有一个包含许多图像的文件夹。这些被分组为一组三个图像，其中一个文件名以dsRed).tif 结尾，另一个文件名以FITC).tif 结尾，另一个文件名以DAPI).tif 结尾。

我如何告诉 ImageJ 对每个图像执行不同的操作，具体取决于它具有哪个文件名结尾？

我尝试设置宏来运行不同的阈值，例如：

//run("Brightness/Contrast...");
setMinAndMax(0, 20000);
close();

根据此处找到的脚本添加到不同的文件名： http://imagej.1557.x6.nabble.com/open-file-with-specific-partial-name-td5002910.html 和这里： http://rsb.info.nih.gov/ij/macros/Batch_RGB_Merge.txt 但我在格式化时遇到问题，如果其他功能与我的三个文件名结尾一起使用。

【问题讨论】：

标签： imagej imagej-macro

【解决方案1】：

您可以使用随后的if ... else 语句检查文件名：

if (endsWith(filename,"dsRed).tif") {
    // do dsRed processing here
} else if (endsWith(filename,"FITC).tif") {
    // do FITC processing here
} else if (endsWith(filename,"DAPI).tif") {
    // do DAPI processing here
}

如果您想对包含相同基本名称的文件进行分组，请仅在您的一个频道上循环（例如dsRed）并使用replace：

replace(filename, "dsRed).tif", "FITC).tif");

在每个循环迭代中处理相应的其他通道。

【讨论】：

非常感谢 Jan. 宏：dir = getDirectory("image");名称=获取标题； if (endsWith(name,"dsRed).tif")) { //运行 dsRed 东西 run("Close"); } else if (endsWith(name,"FITC).tif")) { //运行 FITC 的东西 run("Close"); } else if (endsWith(name,"DAPI).tif")) { //运行 DAPI 的东西 run("Close"); } 工作得很好。