从元数据手动将比例尺添加到 ImageJ / FIJI答案

【问题标题】：Adding Scale bar to ImageJ / FIJI manually from metadeta从元数据手动将比例尺添加到 ImageJ / FIJI
【发布时间】：2014-04-30 16:46:07
【问题描述】：

如何向 Tif 图像添加比例尺？我拥有的元数据是 tif.anx、tif.eax 和 XML 文件的形式。我不明白如何将它添加到我的图像中，以便获得比例尺。

【问题讨论】：

标签： imagej

【解决方案1】：

根据this ticket，Bio-Formats 计划支持徕卡立体显微镜格式，但尚未提供。

但是，您的文件 image46.tif.anx 包含以下行：

<Calibration>
    <Units>mm</Units>
    <MetresPerPixel>1E-06</MetresPerPixel>
</Calibration>

所以在斐济打开纯 tif 文件后，您可以通过Image > Properties... 对话框手动设置刻度校准，或使用宏代码：

run("Properties...", "unit=mm pixel_width=1E-03 pixel_height=1E-03");

或者，使用 Java 或 Javascript：

IJ.run(imp, "Properties...", "unit=mm pixel_width=1E-03 pixel_height=1E-03");

然后，您可以通过Analyze > Tools > Scale Bar... 或通过以下示例宏代码添加比例尺：

run("Scale Bar...", "width=0.1 height=4 font=14 color=White background=None location=[Lower Right] bold overlay");

【讨论】：