在ruby中递归匹配两行之间的所有行答案

【问题标题】：Matching all lines between two lines recursively in ruby在ruby中递归匹配两行之间的所有行
【发布时间】：2015-08-07 06:34:24
【问题描述】：

我想匹配以“SLX-”开头的两行之间的所有行（包括第一行），将它们转换为逗号分隔的行，然后将它们附加到文本文件中。

原始文本文件的截断版本如下所示：

SLX-9397._TC038IV_L_FLD0214.Read1.fq.gz
Sequences: 1406295
With index: 1300537
Sufficient length: 1300501
Min index: 0
Max index: 115
0       1299240
1       71
2       1
4       1
Unique: 86490
# reads processed: 86490
# reads with at least one reported alignment: 27433 (31.72%)
# reads that failed to align: 58544 (67.69%)
# reads with alignments suppressed due to -m: 513 (0.59%)
Reported 27433 alignments to 1 output stream(s)
SLX-9397._TC044II_D_FLD0197.Read1.fq.gz
Sequences: 308905
With index: 284599
Sufficient length: 284589
Min index: 0
Max index: 114
0       284290
1       16
Unique: 32715
# reads processed: 32715
# reads with at least one reported alignment: 13114 (40.09%)
# reads that failed to align: 19327 (59.08%)
# reads with alignments suppressed due to -m: 274 (0.84%)
Reported 13114 alignments to 1 output stream(s)
SLX-9397._TC047II_D_FLD0220.Read1.fq.gz

我想红宝石会是什么样子

将带有 SLX- 的两行之间的所有 /n 转换为逗号
将原始文本文件另存为新文本文件（或者更好的是 CSV 文件。

我认为我对如何在两个特定行之间查找和替换特别有问题。

我想我可以在不使用 ruby 的情况下做到这一点，但是看到我正在尝试进入 Ruby...

【问题讨论】：

对于以字符“SLX”开头的行之间的每一行，我基本上想要一个逗号而不是换行符。这应该包括带有 SLX 的第一行，但不包括最后一行
Read the file line by line 如果一行以SLX- 开头，则开始构建一个新的逗号分隔字符串。一旦该行以SLX- 开始，停止构建字符串save it into the new file，并重新开始构建输出字符串。
好的，但我不能做的是'如果一行以 SLX 开头- 开始构建一个新的逗号分隔字符串。一旦该行以 SLX- 开头，停止构建字符串'。

标签： ruby regex textmate

【解决方案1】：

假设你的字符串在str:

require 'csv'
CSV.open("/tmp/file.csv", "wb") do |csv|
  str.scan(/^(SLX-.*?)(?=\R+SLX-)/m).map do |s| # break by SLX-
    s.first.split($/).map do |el|               # split by CR
      "'#{el}'"                                 # quote values
    end                           
  end.each do |line|                            # iterate
    csv << line                                 # fulfil csv
  end
end

【讨论】：

【解决方案2】：

我对 Ruby 了解不多，但这应该可以。您应该将整个文件读入一个 Sting。使用此正则表达式 - (\RSLX-) - 匹配所有 SLX-（除第一个之外的所有）并将其替换为 ,SLX-。正则表达式的解释请到https://regex101.com/r/pP3pP3/1

这个问题 - Ruby replace string with captured regex pattern - 可能会帮助您了解如何在 ruby 中替换

【讨论】：