将非标准 JSON 数据从 REST API 映射到 FHIR

Question

我目前正在构建一个没有附加数据库的 REST API“桥”，我想从另一个 API 转换 JSON 响应，将其转换为 FHIR，然后将其传递给请求它的客户端。

因为 FHIR 本身的详细实现要求，我想用node-fhir-server-core 来做这件事。在哪里实现非 FHIR 到 FHIR 映射功能？是否可以使用node-fhir-server-core？如果不是，如何使用普通的express 应用程序实现 FHIR 验证/支持？

Answer 1

短版：

你需要弄清楚“https://github.com/Asymmetrik/node-fhir-server-core”是否支持什么

Hapi Fhir 服务器调用“普通服务器” :: https://hapifhir.io/hapi-fhir/docs/server_plain/introduction.html

Vonk 称其为“门面” :: https://fire.ly/products/vonk/vonk-fhir-facade/

在他们的图表中（下......向右下方）我看到“资源提供者”，但我不确定这是“您的自定义资源提供者”还是“我们的（不对称的）内置资源提供者”。

我查看了他们的一些文档，但没有看到任何关于“如何实现您自己的自定义资源提供程序”的内容。 （我从这里开始并做了一些挖掘）。 https://github.com/Asymmetrik/node-fhir-server-core/blob/master/docs/GettingStarted.md

但希望这些其他人称之为此类设置的面包屑.. 将有助于您的搜索。

如果你发现了什么具体的东西，那么请回来报告，我自己也很好奇。

但是使用 hapi 或 vonk，您将拥有一个 fhir 服务器设置，它会接收请求（通常是 GET），将请求转换为您的（其他）内部 REST 服务器...取回数据，将其转换为fhir（此时通常为 r4）资源........这将被发送到最终客户端。简而言之，就是“适配器”设计模式。

加长版：

如果您将数据“收集”到您的专有数据库中，那很好。 然后，您将设置一个 fhir 服务器来公开该数据。 Hapi Fhir “普通服务器”或 Vonk（付费产品）外观模式将是将这些数据暴露给外界的路径。您将获取您的专有信息并将其转换为 fhir 对象并公开。

选项 2。 由于您有新代码，您可以尝试将数据作为 FHIR 对象存储到您的数据存储（db 或 nosql）中。然后将这些对象暴露给外部世界。

FHIR 是.......一种常见的众所周知的对象模型。医疗保健聊天的“语言”。

我个人的比喻是……“就像每个人都开始互相说英语，但更多的是有人说美式英语，有人说英式英语”。我的意思是……它并不总是完美的。在少数情况下，闲聊并不完美。但它很接近。而且比所有事情都必须有翻译要好得多。

如果您阅读了这篇（下文）关于“普通服务器”（普通 fhir 服务器）的文章（这是关于将您现有的专有数据转换为 fhir 资源）

https://hapifhir.io/hapi-fhir/docs/server_plain/introduction.html

vs（hapi 称之为“jpa”，但通常是“全能”fhir 服务器

https://hapifhir.io/hapi-fhir/docs/server_jpa/introduction.html

......

您将开始看到设置 fhir 服务器的不同选择。

如果您有一个空白数据存储（数据库、nosql 等），则有几个选项可用于设置 fhir 服务器。

Hapi Fhir + JPA 支持的数据存储。

使用 CosmoDB 或 Sql Server 的 MS Fhir Server（开源）。

（付费产品）Vonk“全进”服务器。

“Spark”是一个较旧（但开源）的 fhir 服务器。

........

但是，大多数人无法从空白数据存储开始。

那么你有几个选择。

Hapi Fhir，您可以在其中为 IResourceProvider 编写实现（您将在其中编写 PatientResourceProvider，（任何/大多数其他 Fhir 资源）......等等。

Vonk（一种付费产品）的概念与他们称之为 Facade Pattern 的概念相同。

.......

目前，我不知道混合动力车。您必须选择其中一个（空白数据存储或适配器/iresourceprovider/facade 模式。

........

好的，如果你想创建一个fhir服务器。

........

您可能只想使用其他人的 fhir 服务器。然后，您想查看“fhir 客户端”以与其他人的 fhir 服务器一起工作。

hapi 有一个客户

https://hapifhir.io/hapi-fhir/docs/client/introduction.html

可能还有其他人。

…………

现在，针对您的具体选择。

您可能不想维护对象模型。您希望重用创建对象模型的其他人的工作。

https://www.nuget.org/packages/Hl7.Fhir.R4/2.0.0-beta1

Firely（Vonk 背后的公司）提供了一个开源的 dotnet 对象库。 hapi 有一个 java 对象库。

您应该选择一种可以使用这些可重用对象库的语言。 如果python有一个，那么我想你可以使用python。就个人而言，我不会。我会继续使用 dotnet-core（开源）或 java。可能有一个 python fhir 对象模型库，但如果没有......我不会选择 python。模仿所有图书馆的东西太难了。
.........

这里是一些一般性的文档起点。

https://hapifhir.io/hapi-fhir/docs/model/working_with_resources.html

（在链接中获取以下信息......有点盐，有些信息已经过时了）

https://wiki.hl7.org/Open_Source_FHIR_implementations

https://wiki.hl7.org/Publicly_Available_FHIR_Servers_for_testing

https://en.wikipedia.org/wiki/Fast_Healthcare_Interoperability_Resources

.......

个人想法。

我会为 fhir 项目选择 dotnet-core 或 java。再次，在 fhir 中找到更成熟的语言（现在，不希望未来的东西）。

不是每个人都在谈论的东西：

当您公开特定于患者的数据（也就是以非汇总方式）时，您必须考虑患者匹配问题。您不能只说“这是观察结果”。您必须能够说“这是患者 ''John Smith'' 的观察结果，我 99.9999% 确信我正在为您提供（正确）John Smith 的数据。做不要小看这个问题。