tiff() 分辨率和压缩在 OSX 中没有可靠地设置

Question

tiff() 中的分辨率和压缩选项在我的系统上似乎被忽略了（请参阅下面的信息）。这似乎与this SO question 中讨论的问题相同；我在此处发布问题，以便更具体地了解我的系统。

比如下面的代码，

x <- rnorm(1000)
tiff("example.tiff", height=3, width=5, units="in", res=200, compression="lzw")
hist(x)
dev.off()

生成的 .tiff 文件表面上看起来不错，但是当我使用 Photoshop 查看图像大小时，我看到了这个

这与tiff() 创建具有正确像素数但以英寸为单位的大小错误的文件一致。 （当我想控制图像的字体大小和图像大小时，这种差异给我带来了麻烦，例如对于需要特定物理图像大小的出版物）。

请注意，该文件也是 2.5 MB，对于 3"×5" 黑白 lzw 压缩的 tiff 来说似乎太大了。我怀疑压缩选项也被忽略了。

ggsave（可能依赖于 tiff() ？）和png() 得到了相同的结果，所以这似乎是 R 和 OSX 处理图像文件的方式的普遍问题。

我正在使用 R Studio 0.97.449，在 OSX 10.8 上使用 R 3.0.0，详情如下。

> sessionInfo()
R version 3.0.0 (2013-04-03)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.0.0

Answer 1

我使用与您相同的 R 和 OS X 版本。当我运行您的示例然后使用 ImageMagick 调用图像详细信息时，我在控制台中看到以下内容（已编辑）：

$ identify -verbose /Users/schaunw/Desktop/example.tiff
Image: /Users/schaunw/Desktop/example.tiff
Format: TIFF (Tagged Image File Format)
Class: DirectClass
Geometry: 1000x600+0+0
Units: PixelsPerInch
Type: GrayscaleAlpha
Endianess: MSB
Colorspace: Gray
Depth: 8-bit
Page geometry: 1000x600+0+0
Dispose: Undefined
Iterations: 0
Compression: None
Orientation: TopLeft
Filesize: 2.402MB
Number pixels: 600K

文件大小，正如您所指出的，如果对于应该很小的图像来说相当大，并且它显示出缺乏压缩。当我尝试更改 tiff 函数中的 type 参数时，该问题的答案就显现出来了：OS X 告诉我它不再支持 X11，如果我想使用它，我需要手动安装它（见http://www.macrumors.com/2012/02/17/apple-removes-x11-in-os-x-mountain-lion-shifts-support-to-open-source-xquartz/)。

所以我安装了它，然后再次运行您的示例代码，但这次将type 设置为“cairo”。这是我后来从 ImageMagick 得到的：

$ identify -verbose /Users/schaunw/Desktop/example.tiff
Image: /Users/schaunw/Desktop/example.tiff
Format: TIFF (Tagged Image File Format)
Class: DirectClass
Geometry: 1000x600+0+0
Resolution: 200x200
Print size: 5x3
Units: PixelsPerInch
Type: Grayscale
Endianess: MSB
Colorspace: Gray
Depth: 8-bit
Page geometry: 1000x600+0+0
Dispose: Undefined
Iterations: 0
Compression: LZW
Orientation: TopLeft
Filesize: 19.8KB
Number pixels: 600K

请注意适当的小文件大小和 LZW 压缩，但也请注意这次 ImageMagick 明确声明打印大小为 5x3。它以前没有这样做。

所以看起来您的问题与不再随 X11 一起提供的 OS X 有关。安装 X11 应该可以解决您的问题。