如何正确创建新环境 - 包括使用“pip install something”

Question

任何人都可以推荐如何做以下最聪明的事情：

• 创建一个名为“wells”的新环境
• 除了 anaconda 包，如 matplotlib、numphy、pandas ++，
• 安装包如
  • “pip install lasio”、“pip install dlisio”、..

尝试克隆 anaconda，但 30 多分钟后我停止了它。

Answer 1

在速度方面，我建议从Miniconda3 开始，并在安装后立即运行这些命令以确保尽可能从conda-forge 安装所有软件包：

conda config --add channels conda-forge
conda config --set channel_priority strict

要创建环境，我建议使用environment file。创建一个名为 environment.yml 的文本文件，您可以在其中指定通过 conda 可用的包，例如conda-forge（在这种情况下为 numpy、matplotlib、pandas）以及通过 pip 提供的软件包的单独列表，例如PyPI: lasio，在这种情况下是 dlisio。

示例environment.yml 文件：

name: examplename
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - python
  - numpy
  - matplotlib
  - pandas
  - pip:
    - lasio
    - dlisio

然后你可以使用这个命令创建环境wells：

conda env create -n wells -f environment.yml

Answer 2

这是一种方法，它使用 Python3.x。我运行了这个来验证它会比你经历的 30 多分钟更快​​。花了不到4分钟。所以希望这对你有用。

# Create a work directory
mkdir wells
cd wells

# Create a virual environement named 'wells'
python3 -m venv wells
# Start the virual environment
source wells/bin/activate
# Update the basic virtual environment tools
pip install -U pip setuptools

# Create a requirements.txt with all the packages to install
echo matplotlib >>requirements.txt
echo numpy >> requirements.txt
echo pandas >> requirements.txt 
echo lasio >> requirements.txt 
echo dlisio >> requirements.txt

# Install the packages
pip install -r requirements.txt

使用完虚拟环境后，使用以下命令将其停用：

deactivate

此外，如果使用 Conda 环境而不是 Python -m venv 虚拟环境，请参阅以下链接了解步骤：
https://conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html
https://www.anaconda.com/blog/using-pip-in-a-conda-environment

此外，使用 Miniconda 而不是完整的 Anaconda 会更快，因为不需要的 pkg 更少。