【问题标题】:How to select top n columns from time series data instead of using nlargest in pandas?如何从时间序列数据中选择前 n 列而不是在 pandas 中使用 nlargest?
【发布时间】:2021-04-30 13:58:33
【问题描述】:

我有基于每周的贸易出口时间序列数据,我需要制作堆积条形图以可视化贸易活动。为此,我汇总了我的数据以汇总所有行的每列,然后使用nlargest() 选择前 n 列。但是,这样做可能不太准确,因为我在循环中制作了不同年份的堆叠图,并且每年的前 n 列可能不同。但是我所做的是,取所有行(也就是包括所有年份)的每一列的总和,然后选择前 n 列,这是有偏差的。所以,我正在研究这样做的不同方式,也许,我可以按每年对时间序列数据进行分组,然后制作堆积图。是否有其他方法可以从时间序列数据中选择前 n 列而不是使用nlargest?有谁知道这样做的任何可能的方法?还有什么其他方法可以从时间序列数据中选择前 n 列?有什么想法吗?

我目前的尝试

这是我目前处理时间序列数据的尝试,我汇总所有行的每一列,然后使用nlargest() 选择前 n 列:

import pandas as pd

# load the data
url = 'https://gist.githubusercontent.com/adamFlyn/a6048e547b5a963c7af356c964d15af6/raw/c57c7915cf14f81edc9d5eadaf14efbd43d3e58a/trade_df.csv'
df_ = pd.read_csv(url, parse_dates=['weekly'])
df_.set_index('weekly', inplace=True)
df_.loc['Total',:]= df_.sum(axis=0)
df1 = df_.T
df1 =df1.nlargest(6, columns=['Total'])
df1.drop('Total', axis=1, inplace=True)
df2 = df1.T
df2.reset_index(inplace=True)
df2['weekly'] = pd.to_datetime(df2['weekly'])
df2['year'] = df2['weekly'].dt.year
df2['week'] = df2['weekly'].dt.strftime('%W').astype('int')

然后我使用matplotlib 可视化绘图数据,如下所示:

import matplotlib.pyplot as plt

plt_df = df2.set_index(['year','week'])
plt_df.drop("weekly", axis=1, inplace=True)
for n, g in plt_df.groupby(level=0):
    ax = g.loc[n].plot.bar(stacked=True, title=f'{n} Year', figsize=(8,5))
    plt.show()

虽然output of current approach in stacked 的情节很好,但使用nlargest() 选择前n 列并不十分准确。例如,在2019 年美国农业部的报告中,中国不是美国的最大贸易伙伴,但在2020 年末,中国正在从美国获得更多产品,如果我使用nlargest() 选择顶部列(或贸易伙伴),这将是有问题的,中国不会在列表中,也不会在情节中。

更新

正如@Vaishali 在this post 的评论中所建议的那样,使用head() 提取顶部列可能是个好主意,所以我尝试这样:

for n, g in plt_df.groupby(level=0):
    for i in g:
        gg = g[i].sort_values(g[i].values,ascending = False).groupby('week').head(5)
        ax = gg.loc[n].plot.bar(stacked=True, title=f'{n} Year', figsize=(8,5))

但这不起作用。谁能指出我如何从时间序列数据中选择前 n 列?有什么想法吗?

【问题讨论】:

  • 我认为您正在寻找 head() 而不是 nlargest()。 stackoverflow.com/questions/41825978/…
  • @Vaishali 我使用上面SO 帖子中建议的head 更新了我的帖子,但它不起作用。您能否详细说明您对如何解决此问题的想法?有什么想法吗?
  • 我无法读取我机器上的数据。如果您发布 df 的前几行,那么有人会更容易查看它
  • @Vaishali 非常感谢您的意见。我预计不同年份的国家/地区列表可能会有所不同或略有不同,所以我尝试了类似df2.loc[:,(df2.groupby(level=0).sum().rank(axis=1, ascending=False)<6).any()] 的方法。我们应该如何正确地做到这一点?
  • 查看我的编辑。您可以在循环内过滤 df 以按年份拥有顶级国家/地区

标签: python pandas time-series


【解决方案1】:

你可以试试这样的:

url = 'https://gist.githubusercontent.com/adamFlyn/a6048e547b5a963c7af356c964d15af6/raw/c57c7915cf14f81edc9d5eadaf14efbd43d3e58a/trade_df.csv'
df_ = pd.read_csv(url, parse_dates=['weekly'])
df_['weekly'] = pd.to_datetime(df_['weekly'])
df_.set_index('weekly', inplace=True)

for g, n in df_.groupby(df_.index.year):
    ng = n.loc[:, n.sum().rank(ascending=False, method='min')<5]
    ng.div(ng.sum(axis=1), axis=0).plot.area(title=f'{g}')

输出:

条形图:

将 matplotlib.ticker 导入为 mticker

url = 'https://gist.githubusercontent.com/adamFlyn/a6048e547b5a963c7af356c964d15af6/raw/c57c7915cf14f81edc9d5eadaf14efbd43d3e58a/trade_df.csv'
df_ = pd.read_csv(url, parse_dates=['weekly'])
df_['weekly'] = pd.to_datetime(df_['weekly'])
df_.set_index('weekly', inplace=True)

for g, n in df_.groupby(df_.index.year):
    ng = n.loc[:, n.sum().rank(ascending=False, method='min')<5]
    ng.index = ng.index.strftime('%m/%d/%Y')
    ax = ng.plot.bar(stacked=True, figsize=(10,8))

输出:

质押 100% 条形图:

#(previous code)
ax = ng.div(ng.sum(axis=1), axis=0).plot.bar(stacked=True, figsize=(10,8))

输出:

【讨论】:

  • 这很有趣并且接近我的预期答案。我们也可以制作堆积条形图吗?
  • 我们应该如何制作 x 轴显示 52 周的堆积条形图?有什么可能的想法吗?
【解决方案2】:

我不确定我是否正确理解了这里的要求,但这是基于您的输出图表:

使用 sum 和 nlargest 查找前 n 个国家 按 top_countries、groupby 年份和周、sum 过滤 df 对于每个独特的年份,绘制堆积图

df.columns = df.columns.str.strip()
top_countries = df.iloc[:, 1:].sum().nlargest(6).index.tolist()
df['weekly'] = pd.to_datetime(df['weekly'])
agg = df[top_countries].groupby([df['weekly'].dt.year.rename('year'),df['weekly'].dt.week.rename('week')]).sum()
for year in df['weekly'].dt.year.unique():
    agg[agg.index.get_level_values(0) == year].droplevel(level=0).plot.bar(stacked = True, figsize = (10,5), title = year)

编辑: 如果您想按年份过滤排名靠前的国家/地区,请将您过滤 df 的部分移到循环中,

df.columns = df.columns.str.strip()
df['weekly'] = pd.to_datetime(df['weekly'])
for year in df['weekly'].dt.year.unique():
    top_countries = df.iloc[:, 1:].sum().nlargest(6).index.tolist()
    agg = df[top_countries].groupby([df['weekly'].dt.year.rename('year'),df['weekly'].dt.week.rename('week')]).sum()

    agg[agg.index.get_level_values(0) == year].droplevel(level=0).plot.bar(stacked = True, figsize = (10,5), title = year)

【讨论】:

    【解决方案3】:

    你可以试试这个

    import pandas as pd
    
    # load the data
    url = 'https://gist.githubusercontent.com/adamFlyn/a6048e547b5a963c7af356c964d15af6/raw/c57c7915cf14f81edc9d5eadaf14efbd43d3e58a/trade_df.csv'
    df = pd.read_csv(url, parse_dates=['weekly'])
    df['weekly'] = pd.to_datetime(df['weekly'])
    df['year'] = df['weekly'].dt.year
    df['week'] = df['weekly'].dt.strftime('%W').astype('int')
    df.set_index(['year', 'week'], inplace=True)
    df.drop('weekly', axis=1, inplace=True)
    
    df_year_sums = df.groupby(level='year').sum().T
    
    for year in df_year_sums.columns:
        largest = list(df_year_sums[year].nlargest(6).index)  
        df_plot = df.xs(year, level='year')[largest]
        df_plot.plot.bar(stacked=True, title=f'{year} Year', figsize=(8,5))
    

    【讨论】:

      【解决方案4】:
      df=pd.read_csv('trade_df.csv',parse_dates=['weekly'])
       df['weekly']=pd.to_datetime(df['weekly'])
       df['Total']=0
       df.reset_index()
       for key,row in df.iterrows():
           sum=0.0
           for row_value in row:
              if type(row_value)==float:
                  sum+=row_value
           df.loc[key,'Total']=sum
      
       results=df.sort_values(by="Total",ascending=False)
      
       print(results.head(5))   
      
      
       #grouped=df.groupby('year').sum().T.plot.bar(stacked=True)
       #plt.show() 
      
       filter=df['year'].isin([2018])
       results_2018=df[filter].sort_values(by=['total'],ascending=False).head(5)
      
       filter=df['year'].isin([2019])
       results_2019=df[filter].sort_values(by=['total'],ascending=False).head(5)
      
       filter=df['year'].isin([2020])
       results_2020=df[filter].sort_values(by=['total'],ascending=False).head(5)
      
       grouped=df.groupby('year').sum().T.plot.bar(stacked=True)
       plt.show()
      
       fp=results_2018.pivot_table(index=['week'],aggfunc='sum').fillna(0)
       fp = fp[(fp.T != 0).any()]
      
       fp2=results_2019.pivot_table(index=['week'],aggfunc='sum').fillna(0)
       fp2 = fp2[(fp2.T != 0).any()]
      
       fp3=results_2020.pivot_table(index=['week'],aggfunc='sum').fillna(0)
       fp3 = fp3[(fp3.T != 0).any()]
      
       #print(fp)
       fig,ax=plt.subplots(3,1,figsize=(16,16))
       fp.plot.bar(stacked=True,ax=ax[0])
       fp2.plot.bar(stacked=True,ax=ax[1])
       fp3.plot.bar(stacked=True,ax=ax[2])
       plt.show()
      

      【讨论】:

        【解决方案5】:
        df = pd.DataFrame(np.random.randint(1,100,(100)),columns=["column1"])
        results=np.array(df.sort_values(by="column1",ascending=False)).flatten()
        print(results[:5])
        

        【讨论】:

        • 你能尝试一下时间序列数据吗,就像我尝试的那样?我认为这不是我所期望的。任何可能的更新?谢谢
        • 您在哪个字段上排序?汇总的字段是什么?
        • 我认为我们添加了名为“total”的新文件,但不确定您给定的尝试如何适用于我使用的时间序列数据。您介意尝试time series data that I used 吗?谢谢!
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