合并具有重复项的 data.frames

Question

我有很多data.frames，例如：

df1 = data.frame(names=c('a','b','c','c','d'),data1=c(1,2,3,4,5))
df2 = data.frame(names=c('a','e','e','c','c','d'),data2=c(1,2,3,4,5,6))
df3 = data.frame(names=c('c','e'),data3=c(1,2))

我需要合并这些data.frames，而不删除重复的名称

> result
  names data1 data2 data3
1  'a'    1    1      NA
2  'b'    2    NA     NA
3  'c'    3    4      1
4  'c'    4    5      NA
5  'd'    5    6      NA
6  'e'    NA   2      2       
7  'e'    NA   3      NA

我找不到像合并选项这样的功能来处理名称重复。谢谢您的帮助。 定义我的问题。数据来自生物实验，其中一个样本具有不同数量的重复。我需要合并所有的实验，我需要生成这个表。我无法为复制生成唯一标识符。

Answer 1

首先定义一个函数run.seq，它为重复项提供序列号，因为从输出中可以看出，需要关联合并的每个组件中每个名称的第 i 个重复项。然后创建一个数据框列表，并为每个组件添加一个run.seq 列。最后使用Reduce将它们全部合并。

run.seq <- function(x) as.numeric(ave(paste(x), x, FUN = seq_along))

L <- list(df1, df2, df3)
L2 <- lapply(L, function(x) cbind(x, run.seq = run.seq(x$names)))

out <- Reduce(function(...) merge(..., all = TRUE), L2)[-2]

最后一行给出：

> out
  names data1 data2 data3
1     a     1     1    NA
2     b     2    NA    NA
3     c     3     4     1
4     c     4     5    NA
5     d     5     6    NA
6     e    NA     2     2
7     e    NA     3    NA

编辑：修改 run.seq 以便输入不需要排序。

Answer 2

查看其他问题：

• How to join data frames in R (inner, outer, left, right)
• recombining-a-list-of-data-frames-into-a-single-data-frame
• ...

例子：

library(reshape)
out <- merge_recurse(L)

或

library(plyr)

out<-join(df1, df2, type="full")
out<-join(out, df3, type="full")
*can be looped

或

library(plyr)
out<-ldply(L)

Answer 3

我认为您的示例数据框中没有足够的信息来执行此操作。数据帧 1 中的哪个 'c' 应该与数据帧 2 中的哪个 'c' 配对？我们不能说，所以 R 也不能。我怀疑您必须向每个数据框添加另一个变量，以唯一标识这些重复案例。