Pypi 和 Cython

Question

我正在尝试整理我的第一个 PyPi 包，但我对它的一些基本方面感到困惑。

我的包依赖于SNPknock。当我尝试在新系统（Ubuntu 18.04）上安装它时，我得到：

pip install snpknock
Collecting snpknock
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/68/a0/ceb6adc2b7f1a3009f2077c157a99640094021a66f881cb678ecf4
78887f/SNPknock-0.5.2.tar.gz
    Complete output from command python setup.py egg_info:
    You don't seem to have Cython installed. Please get a
    copy from www.cython.org and install it

我已经提取了 setup.py from the tarball here，其中包括该错误消息。

这是我的困惑。 setup.py 文件将 Cython 指定为依赖项：

DEPENDENCIES = ['Cython>='+CYTHON_MIN_VERSION,
                'numpy>='+NUMPY_MIN_VERSION]

但是，它也导入 Cython，但似乎需要这样做才能对某些模块进行 cython 化。这一切似乎有点循环，但我怀疑我（或这个包的作者）在这个过程中遗漏了一些东西。

Answer 1

问题似乎是您的平台没有轮子/鸡蛋。在这种情况下，pip 下载源代码并运行python setup.py install。如果setup.py 导入Cython，那么Cython 是否被列为依赖项并不重要。在运行pip install 之前，您必须拥有Cython，因为如果不运行setup.py，pip 无法从源代码中获取依赖项列表，而setup.py 需要Cython 才能被导入。

如果snpknock 曾经为您的 Python 版本发布过鸡蛋或轮子，pip 会下载它，获取依赖项列表并在不咨询setup.py 的情况下安装它们；之后它会安装软件包。在这种情况下，pip 会自动下载 Cython 或直接从 egg/wheel 安装已编译的扩展。