Matplotlib 子图太窄，布局紧凑

Question

我目前正在尝试使用 GridSpec 在 Matplotlib（Python 3.6、Matplotlib 2.0.0）中绘制许多子图。这是最小的工作示例：

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.gridspec import *

# Color vector for scatter plot points
preds = np.random.randint(2, size=100000)

# Setup the scatter plots
fig = plt.figure(figsize=(8,8))
grid = GridSpec(9, 9)

# Create the scatter plots
for ii in np.arange(0, 9):
    for jj in np.arange(0, 9):
        if (ii > jj):
            ax = fig.add_subplot(grid[ii, jj])
            x = np.random.rand(100000)*2000
            y = np.random.rand(100000)*2000
            ax.scatter(x, y, c=preds)

这是未经任何修改的结果：

当然，子图之间的间距不能令人满意，所以我做了我通常做的事情并使用了tight_layout()。但是从下图中可以看出，tight_layout() 压缩了地块的宽度让人无法接受：

我认为我应该使用 subplots_adjust() 手动调整子图，而不是使用 tight_layout()。下图为subplots_adjust(hspace=1.0, wspace=1.0)。

结果几乎是正确的，再稍微调整一下子图之间的空间就会很完美。然而，子图似乎太小而无法充分传达信息。

有没有更好的方法来获得子图之间的适当间距，同时仍保持纵横比和足够大的子图大小？我能想到的唯一可能的解决方案是使用subplots_adjust() 和更大的figsize，但这会导致图形边缘和子图之间的空间非常大。

感谢任何解决方案。

Answer 1

由于所有坐标轴都具有相同的x 和y 范围，我会选择仅在外部Axes 上显示刻度标签。对于大小相等的子图网格，可以使用 plt.subplots() 的 sharex 和 sharey 关键字轻松实现自动化。当然，如果您设置了一个 9x9 子图的网格，这会给您提供比您想要的更多的图，但是您可以使冗余图不可见（例如使用 Axes.set_visible 或完全删除它们。在下面的示例中，我使用后者。

from matplotlib import pyplot as plt
import numpy as np

fig, axes = plt.subplots(
    nrows=9, ncols=9, sharex=True, sharey=True, figsize = (8,8)
)

# Color vector for scatter plot points
preds = np.random.randint(2, size=1000)

# Create the scatter plots
for ii in np.arange(0, 9):
    for jj in np.arange(0, 9):
        if (ii > jj):
            ax = axes[ii,jj]
            x = np.random.rand(1000)*100
            y = np.random.rand(1000)*2000
            ax.scatter(x, y, c=preds)
        else:
            axes[ii,jj].remove() ##remove Axes from fig
            axes[ii,jj] = None   ##make sure that there are no 'dangling' references.    

plt.show()

生成的图形如下所示：

这当然可以用subplots_adjust() 之类的东西进一步调整。希望这会有所帮助。