【发布时间】:2019-09-21 18:14:11
【问题描述】:
我想创建一个子例程,它接受一个ALLOCATABLE 数组并返回一个 MPI 共享内存数组。
我有一堆用 MPI 编写的代码,我们使用 ALLOCATABLE 数组。现在,许多这些数组在节点之间是相同的,因此最好将它们存储在某种类型的共享内存对象中。现在我找到了这个示例 (MPI Fortran code: how to share data on node via openMP?),它作为独立代码工作,但是当我尝试将其作为子例程实现时,我从 C_F_POINTER 调用中得到了分段错误。
驱动程序看起来像
PROGRAM TEST_SUBROUTINE
! Libraries
USE MPI
IMPLICIT NONE
! Variables
INTEGER :: ier, myid, numprocs
INTEGER :: myid_shar, numprocs_shar
INTEGER :: MPI_COMM_SHARMEM, win_a
DOUBLE PRECISION, POINTER :: A(:)
! Code
CALL MPI_INIT(ier)
CALL MPI_COMM_RANK( MPI_COMM_WORLD, myid, ier )
CALL MPI_COMM_SIZE( MPI_COMM_WORLD, numprocs, ier)
myid_shar=0
CALL MPI_COMM_SPLIT_TYPE(MPI_COMM_WORLD, MPI_COMM_TYPE_SHARED, 0, MPI_INFO_NULL, MPI_COMM_SHARMEM, ier)
CALL MPI_COMM_RANK( MPI_COMM_SHARMEM, myid_shar, ier )
CALL MPI_COMM_SIZE( MPI_COMM_SHARMEM, numprocs_shar, ier)
CALL mpialloc_1d_dbl(A,numprocs_shar,myid_shar,0,MPI_COMM_SHARMEM,win_a)
A(myid_shar+1) = myid_shar
CALL MPI_WIN_FENCE(0, win_a, ier)
IF (myid == 0) THEN
PRINT *,A(1)
PRINT *,A(2)
PRINT *,A(3)
PRINT *,A(4)
END IF
! FREE Window
CALL MPI_WIN_FENCE(0, win_a, ier)
CALL MPI_BARRIER(MPI_COMM_SHARMEM, ier)
CALL MPI_WIN_FREE(win_a,ier)
! FREE MPI_COMM_SHARMEM
CALL MPI_BARRIER(MPI_COMM_SHARMEM, ier)
CALL MPI_COMM_FREE(MPI_COMM_SHARMEM,ier)
! END MPI
CALL MPI_BARRIER(MPI_COMM_WORLD, ier)
CALL MPI_FINALIZE(ier)
END PROGRAM TEST_SUBROUTINE
子程序看起来像(注意我尝试过使用数组变量但没有太多运气)
SUBROUTINE mpialloc_1d_dbl(array,n1,subid,mymaster,share_comm,win)
! Libraries
USE MPI
USE ISO_C_BINDING
IMPLICIT NONE
! Arguments
DOUBLE PRECISION, POINTER, INTENT(inout) :: array(:)
INTEGER, INTENT(in) :: n1
INTEGER, INTENT(in) :: subid
INTEGER, INTENT(in) :: mymaster
INTEGER, INTENT(inout) :: share_comm
INTEGER, INTENT(inout) :: win
! Variables
INTEGER :: disp_unit, ier
INTEGER :: array_shape(1)
INTEGER(KIND=MPI_ADDRESS_KIND) :: window_size
TYPE(C_PTR) :: baseptr
ier = 0
array_shape(1) = n1
disp_unit = 8_MPI_ADDRESS_KIND
window_size = 0_MPI_ADDRESS_KIND
IF (subid == mymaster) window_size = INT(n1,MPI_ADDRESS_KIND)
CALL MPI_BARRIER(share_comm, ier)
CALL MPI_WIN_ALLOCATE_SHARED(window_size, disp_unit, MPI_INFO_NULL, share_comm, baseptr, win ,ier)
IF (subid /= mymaster) CALL MPI_WIN_SHARED_QUERY(win, 0, window_size, disp_unit, baseptr, ier)
CALL C_F_POINTER(baseptr, array, array_shape)
CALL MPI_WIN_FENCE(0, win, ier)
RETURN
END SUBROUTINE mpialloc_1d_dbl
我想要的是一个子例程,其行为类似于简单的ALLOCATE 语句,返回共享内存 POINTER 和 FENCE 调用的窗口变量。
【问题讨论】:
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我不确定我什至理解为什么会编译,更不用说段错误了 - 数组应该具有要在 C_F_POINTER 中使用的指针属性。而且你真的应该使用 iso_c_binding 中的 kind 值来确保互操作性,无论如何 Double Precision 是 1980 年代
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它编译(Knightslanding 架构上的英特尔编译器),结果我的伪代码工作正常,但我的实际代码有分段错误。我要再挖一些。
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伪代码无法使用 gfortran 7.4.0 编译:错误:参数 FPTR 在 (1) 到 C_F_POINTER 必须是指针
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如果你给它
POINTER属性,它会编译吗? -
是的 - 我建议您将其包含在自己的代码中并根据需要编辑问题
标签: pointers fortran mpi shared-memory