“mpirun 无法启动指定的应用程序，因为它找不到可执行文件”错误

Question

我遇到了一个奇怪的问题，它有效，但现在无效。

我在 2 台计算机之间运行一个带有 tau 分析的 OpenMPI 程序。貌似mpirun不能在远程主机上运行tau_exec程序，可能是权限问题？

 cluster@master:~/software/mpi_in_30_source/test2$ mpirun -np 2 --hostfile hostfile -d           tau_exec -v -T MPI,TRACE,PROFILE ./hello.exe
 [master:19319] procdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@master_0/4568/0/0
 [master:19319] jobdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@master_0/4568/0
 [master:19319] top: openmpi-sessions-cluster@master_0
 [master:19319] tmp: /tmp
 [slave2:06777] procdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@slave2_0/4568/0/1
 [slave2:06777] jobdir: /tmp/openmpi-sessions-cluster@slave2_0/4568/0
 [slave2:06777] top: openmpi-sessions-cluster@slave2_0
 [slave2:06777] tmp: /tmp
 [master:19319] [[4568,0],0] node[0].name master daemon 0 arch ff000200
 [master:19319] [[4568,0],0] node[1].name slave2 daemon 1 arch ff000200
 [slave2:06777] [[4568,0],1] node[0].name master daemon 0 arch ff000200
 [slave2:06777] [[4568,0],1] node[1].name slave2 daemon 1 arch ff000200
 [master:19319] Info: Setting up debugger process table for applications
   MPIR_being_debugged = 0
   MPIR_debug_state = 1
   MPIR_partial_attach_ok = 1
   MPIR_i_am_starter = 0
   MPIR_proctable_size = 2
   MPIR_proctable:
     (i, host, exe, pid) = (0, master,      /home/cluster/software/mpi_in_30_source/test2/tau_exec, 19321)
     (i, host, exe, pid) = (1, slave2,      /home/cluster/software/mpi_in_30_source/test2/tau_exec, 0)
 --------------------------------------------------------------------------
 mpirun was unable to launch the specified application as it could not find an executable:

 Executable: tau_exec
 Node: slave2

 while attempting to start process rank 1.
 --------------------------------------------------------------------------
 [slave2:06777] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [slave2:06777] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [master:19319] sess_dir_finalize: job session dir not empty - leaving
 [master:19319] sess_dir_finalize: proc session dir not empty - leaving
 orterun: exiting with status -123

在 slave2 上：

cluster@slave2:~/software/mpi_in_30_source/test2$ tau_exec -T MPI,TRACE,PROFILE ./hello.exe
hello MPI user: from process = 0 on machine=slave2, of NCPU=1 processes
cluster@slave2:~/software/mpi_in_30_source/test2$ which tau_exec
/home/cluster/tools/tau-2.22.2/arm_linux/bin/tau_exec

所以两个节点上都有一个工作的 tau_exec。当我在没有 tau_exec 的情况下运行 mpirun 时，一切正常。

cluster@master:~/software/mpi_in_30_source/test2$ mpirun -np 2 --hostfile hostfile  ./hello.exe
hello MPI user: from process = 0 on machine=master, of NCPU=2 processes
hello MPI user: from process = 1 on machine=slave2, of NCPU=2 processes

Answer 1

尝试在命令行中输入tau_exec 的完整路径。您的 PATH 可能在所有节点上都不相同。如果是这种情况，它将无法在路径不正确的任何地方找到可执行文件。

这很可能不是权限问题，但我不记得 Open MPI 中的所有错误消息都告诉您它们可能有多大帮助。

Answer 2

当我尝试命名输出文件时，曾经出现过这样的错误 试着保持原样

    mpirun -n <number> a.out

这就是我的工作原理！

Answer 3

可能是因为你已经安装了 openMPI 而不仅仅是 MPICH2，所以你应该以 root 运行以下命令：

root~# update-alternatives --config mpirun

替代 mpirun 有 2 种选择（提供 /usr/bin/mpirun）。

选择 |路径 |优先 |状态

• *0 | /usr/bin/mpirun.openmpi | 50 |自动模式
• 1 | /usr/bin/mpirun.mpich2 | 40 |手动模式
• 2 | /usr/bin/mpirun.openmpi | 50 |手动模式

按回车键保留当前选择[*]，或输入选择编号：1

那么你应该选择MPICH版本，如上，正常运行。

Answer 4

如果您使用 mpirun 运行 shell 脚本，请确保您有 chmod +x script_file.sh 否则您会看到此错误。