MPI：报告绑定答案

【问题标题】：MPI: Report BindingsMPI：报告绑定
【发布时间】：2014-08-05 03:08:03
【问题描述】：

我正在使用 -rankfile 和 -hostfile 标志运行具有特定绑定的 MPI 程序。我如何检查是否进行了正确的绑定（只是为了确定）？我试过--report-bindings 标志。比如：

mpirun --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file -n 16 ./$prog

但是，它没有为我提供任何输出。我正在使用 Open MPI 1.5.4 版。我做错了什么？

【问题讨论】：

标签： mpi openmpi

【解决方案1】：

可能是您的标准错误（odls 框架正在打印绑定信息）被重定向到某个地方。它适用于我的 Open MPI 1.5.3：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 hostname
host
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],0] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],1] to slot_list 1
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],2] to slot_list 0
[host:18314] [[35226,0],0] odls:default:fork binding child [[35226,1],3] to slot_list 1
host
host
host

如果库由于某种原因未能报告绑定，您可以使用一个简单的脚本来检查绑定是否实际发生：

#!/bin/sh

cpuset=$(cat /proc/self/status | grep Cpus_allowed_list | awk '{print $2;}')
echo "Rank $OMPI_COMM_WORLD_RANK bound to core(s) $cpuset"

只需将其命名为 report_bindings 并通过 mpiexec 运行它：

$ mpiexec --report-bindings -rankfile rank_file -hostfile host_file \
          -n 4 report_bindings
Rank 1 bound to core(s) 8
Rank 0 bound to core(s) 0
Rank 3 bound to core(s) 8
Rank 2 bound to core(s) 0

【讨论】：

很好用。我不知道为什么 --report-bindings 标志没有提供信息。也许我有什么问题。我倾向于对程序输出有这个问题。有时它只是开始给我没有关于输出的信息，但如果我在代码中添加另一个 cout 指令，一切正常。我应该补充一点，这不是因为刷新，因为函数已被相应地调用。
老实说我不知道。通常 Open MPI 的 I/O 重定向非常健壮。