如何在 MPI 代码上从 gprof 获得有意义的结果？

Question

我正在优化 MPI 代码，并且正在使用 Gprof。 问题是我得到的结果是完全不合理的。我的工作流程如下：

• 编译添加-pg作为编译标志的代码。

• 运行代码mpirun -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN。

• 在可执行文件gprof EXEC.exe上运行gprof

这有什么问题？

Answer 1

运行gprof 的说明通常假定程序是串行的，或单进程但多线程的。

要使用像 MPI 程序这样的多进程程序运行 gprof，您需要

1. 确保每个进程都输出自己的文件
2. 跨进程显式汇总文件
3. 在结果上运行 gprof。

This blog post 或 these instructions at LLNL 是很好的起点：

1. 设置记录不充分的GMON_OUT_PREFIX 环境变量，例如在 bash 中，export GMON_OUT_PREFIX=gmon.out- 在运行 mpiexec 命令之前（然后，根据环境，您可能必须运行 mpirun -x GMON_OUT_PREFIX -np Nproc EXEC.exe arg1 ... argN 以确保每个进程都有环境变量）
2. 使用 gprof 本身收集和汇总结果，gprof -s EXEC.exe gmon.out-*
3. gprof EXEC.exe gmon.sum（或者只检查单个文件，或使用gprof EXEC.exe gmon.out-12345 或gprof EXEC.exe gmon.out-* 一起检查文件）