【发布时间】:2012-08-28 14:04:14
【问题描述】:
我最近与 MPI 合作。我对 MPI 还是很陌生。但是我最近在使用 MPICH2 时发现了一个问题。这是我从 Hello world 程序修改而来的 fortran 90 小程序。我还没有测试它的 c 版本,但我认为它们应该非常相似(由函数名称和错误参数不同)。
我正在使用 Windows 7 64 位、MinGW(gcc 版本 4.6.2,它是 32 位编译器)并使用 MPICH2 1.4.1-p1 32 位版本。这是我用来编译简单代码的命令:
gfortran hello1.f90 -g -o hello.exe -IC:\MPICH2_x86\include -LC:\MPICH2_x86\lib -lfmpich2g
下面是简单的代码:
program main
include 'mpif.h'
character * (MPI_MAX_PROCESSOR_NAME) processor_name
integer myid, numprocs, namelen, rc,ierr
integer, allocatable :: mat1(:, :, :)
call MPI_INIT( ierr )
call MPI_COMM_RANK( MPI_COMM_WORLD, myid, ierr )
call MPI_COMM_SIZE( MPI_COMM_WORLD, numprocs, ierr )
call MPI_GET_PROCESSOR_NAME(processor_name, namelen, ierr)
allocate(mat1(-36:36, -36:36, -36:36))
mat1(:,:,:) = 0
call MPI_Bcast( mat1(-36, -36, -36), 389017, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD, ierr )
call MPI_Allreduce(MPI_IN_PLACE, mat1(-36, -36, -36), 389017, MPI_INTEGER, MPI_BOR, MPI_COMM_WORLD, ierr)
print *,"MPI_Allreduce done!!!"
print *,"Hello World! Process ", myid, " of ", numprocs, " on ", processor_name
call MPI_FINALIZE(rc)
end
它可以编译,但是在运行时失败(可能是无效的内存访问?)。 MPI_Allreduce 一定有一些问题,因为如果我删除该行它可以正常工作。如果我使矩阵更小,它也可以工作。我也在具有相同版本 MPI 的 ubuntu 机器上进行了尝试。在 Linux 中没有问题。
当我使用 gdb(MinGW 附带)进行检查时(gdb hello.exe 然后回溯)。我得到了一些毫无意义的东西(或者似乎是为了我自己):
Program received signal SIGSEGV, Segmentation fault.
[Switching to Thread 16316.0x4fd0]
0x01c03100 in mpich2nemesis!PMPI_Wtime ()
from C:\Windows\system32\mpich2nemesis.dll
(gdb) backtrace
#0 0x01c03100 in mpich2nemesis!PMPI_Wtime ()
from C:\Windows\system32\mpich2nemesis.dll
#1 0x0017be00 in ?? ()
#2 0x00000000 in ?? ()
这是否真的意味着 Windows 版本的 MPI 库有问题? 让它发挥作用的解决方案是什么?
谢谢。
【问题讨论】:
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那个 389017 ,mpi_bcast 的 int count 部分对我来说看起来不正确
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也可以测试 mpi 库是否正常工作,为什么不找一个不错的 mpi hello world 示例,看看是否编译
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@pyCthon 你可能是对的,我用 openmpi 得到了更直接的错误消息:[20989] *** MPI_Bcast [20989] 中发生错误 *** 在通信器 MPI_COMM_WORLD [20989] *** MPI_ERR_TYPE:无效数据类型 [20989] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL(再见)
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这对我来说实际上工作得很好,因为我有机会运行代码,我用 mpif90 gcc45 4.5.4_1 进行了测试,所以这绝对是一个与 Windows 相关的错误
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感谢 pyCthon。正如我所说,代码在 Linux 机器上工作,但如果你使用 MinGW + MPICH2 1.4.1p1 会失败。我从 MPICH2 官方网站下载了 MPI。我会在他们的邮件列表中问这个问题,看看他们是否有答案。