【发布时间】：2012-12-09 13:57:04
【问题描述】：
如何使用mpirun 的-machine 标志？
为了选择在哪个集群节点上执行，我想出像这样使用mpirun 的-machinefile 选项
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np <integer> <executable-filename>
Host_file 包含一个节点列表，每行一个。
但是我想提交一大堆具有不同参数的进程，并且我不希望它们在同一个节点上运行。也就是说，我想做类似的事情
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 1
nano Host_file % change the first node name
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 2
nano Host_file
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename 3
nano Host_file
...
我可以使用-machine 标志，然后为每次执行键入不同的节点。但我无法让它工作。例如
> mpirun -machine node21-ib -np 1 FPU
> mpirun -machine node21 -np 1 FPU
始终在主节点上执行。
我也尝试了-nodes 选项
> mpirun -nodes node21-ib -np 1 FPU
> mpirun -nodes node21 -np 1 FPU
但这只是在我当前的节点上执行。
同样，我尝试了-nolocal 和-exclude 选项但没有成功。
所以我有一个简单的问题：如何使用-machine 选项？还是有更好的方法来做到这一点（对于 Linux 新手）？
我正在使用以下版本的 MPI，它在网络上的文档似乎出奇地少（到目前为止，我拥有的全部文档都来自 > mpirun --help）。
> mpichversion
MPICH Version: 1.2.7
MPICH Release date: $Date: 2005/06/22 16:33:49$
MPICH Patches applied: none
MPICH configure: --with-device=ch_gen2 --with-arch=LINUX -prefix=/usr/local/mvapich-gcc --with-romio --without-mpe -lib=-L/usr/lib64 -Wl,-rpath=/usr/lib64 -libverbs -libumad -lpthread
MPICH Device: ch_gen2
感谢您的帮助。
【问题讨论】：
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您的集群不是在 SGE、LSF、Torque 等资源管理器的控制下运行吗？这些通常提供与 MPI 实现集成的方法，以便为每个作业自动提供正确的节点文件。
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我不知道 SGE、LSF 或扭矩是什么。我怀疑我们有这些东西。该集群是一个简单的集群，由非计算机专家的数学教授拥有和管理。
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所有者告诉我
torque已安装，但未激活。他没有计划让它活跃起来。