将变量传递给 awk 时出错答案

【问题标题】：Errors when passing variable to awk将变量传递给 awk 时出错
【发布时间】：2012-02-11 22:27:47
【问题描述】：

我正在尝试使用 awk -v 将外部变量传递给 awk 但就是不知道我的问题是什么！

for ((c=1;c<=22;c++));do cat hg19.gap.bed|awk -v var={chr"$c"} '{if ("$1"=="$var") print}' > $var.cbs;done

这个命令有什么问题？谢谢

【问题讨论】：

【解决方案1】：

在 awk 中，只有字段变量以 $ 开头。而且您不希望在 awk 中使用双引号。试试if ($1 == var) ...。

使用$var实际上意味着存储在var中的索引处的字段，在这种情况下不是有效字段（但您可以使用它来遍历字段）。

【讨论】：

【解决方案2】：

var={chr"$c"} 应该产生什么？

它在这种情况下产生的是{chr1}、{chr2}、...、{chr22}。

请注意，变量 var 是 awk 变量，而不是 shell 变量。您必须重定向到 "{chr$c}.cbs" 才能获得 22 个单独的文件。在脚本中，$var 将始终为$0，因为作为数字评估的var 是0。

比起运行命令 22 次，您肯定可以一次完成所有操作。假设您在 MacOS X (BSD) 或任何符合 POSIX 的awk 上使用gawk (GNU Awk) 或awk，您可以这样写：

awk '$1 ~ /\{chr([1-9]|1[0-9]|2[012])\}/ {file=$1".cbs"; print $0 >file;}' hg19.gap.bed

这一次通过数据文件完成了整个工作。

【讨论】：

【解决方案3】：

我假设 chr 只是一些字符串，而您想与 chr1、chr2、....进行匹配

for ((c=1;c<=22;c++));do cat hg19.gap.bed | awk -v var=chr"$c" '"$1"==var {print}' > chr"$c".cbs;done

让我知道这是否适合你。

【讨论】：