bash awk 保存输出到数组的内容

Question

如何保存在 awk 语句中打印出来的数据？能够访问变量或数组？它经过的每个文件以及所有文件的总和都有 4 个值 (GATC)。如果找到符合标准的文件，它会迭代并打印每一行，并添加它找到的每行的数量，总共四个。不过，我需要稍后才能访问这些信息。虽然它找到的不一定是线条，但我不需要。如何保存到我认为是最好的方法的数组中？

for f in $FILES
do
      [ -d "$f" ] && continue

      if is_file_contains_DNA $f; then
          echo "DNA exist in " $f  >> $SUMMARYPATH
      #touch $OUTFILENAME$f
      awk '/^ATOM/&&substr($0,20,1)~/[GATC]/{print;l++;a[substr($0,20,1)]++}END{printf "total line : %s\n",l;for (i in a) printf "%s : %s \n",i,a[i]}' $f >> $RESULTSPATH$OUTFILENAME$f
      else
          echo "DNA DOES NOT exist in "$f >> $SUMMARYPATH
      fi

done

补充一点：

可能有更简单的解决方案。我可以使用“awk”而不是一个打印出两个文件吗？所以我想打印我现在拥有的结果文件，然后添加到单个“SUMMARY”文件中，就像我为 awk 之前的行所做的那样？

Answer 1

您可以尝试使用 awk 中的文件描述符将一些内容输出到终端并在 bash 数组中捕获其他数据。比如

#! /bin/bash

exec 6>&1

files=(file1 file2)
res=()
numfiles=${#files[@]}

for (( i=0; i<$numfiles; i++)) ; do
    res[$i]=$(awk -f a.awk "${files[$i]}")
done

exec 6>&-

将打开一个编号为 6 的新文件描述符，该描述符将在 awk 中可用，因此 awk 脚本 a.awk 可以是：

/^ATOM/ && substr($0,20,1)~/[GATC]/ {
    print > "/dev/fd/6"
    l++
    a[substr($0,20,1)]++
}
END {
    printf ("total line : %s\n",l) > "/dev/fd/6"
    printf "%s ", l
    for (i in a) {
        printf ("%s : %s \n",i,a[i]) > "/dev/fd/6"
        printf "%s ",a[i]
    }
}