计算一行中的零个数，将计数添加到新列[关闭]答案

【问题标题】：Counting number of zeros in a row, adding count to new column [closed]计算一行中的零个数，将计数添加到新列[关闭]
【发布时间】：2022-01-09 23:29:35
【问题描述】：

我有一个制表符分隔的表格，如下所示：

chr1 100 110 + 2 3 0 8 6
chr1 150 200 + 1 4 0 2 0
chr1 200 220 + 1 4 2 0 0
chr1 250 260 + 4 2 6 1 3

我想计算第 5-9 列中有多少个零，并将该数字添加到第 10 列：

chr1 100 110 + 2 3 0 8 6 1
chr1 150 200 + 1 4 0 2 0 2
chr1 200 220 + 1 4 2 0 0 2
chr1 250 260 + 4 2 6 1 3 0

最终，目标是仅对那些不超过 4 个零的行（至少 2 列非零）进行子集化。我知道如何用awk 做这个子集，但我不知道如何计算这些列中的零。如果有更简单的方法只要求在第 5-9 列之间至少有两列非零，那将是理想的。

【问题讨论】：

您要选择具有两个零的行或添加一个具有零计数的新列？
与其发布一些输出然后说Ultimately, the goal... 并描述您想做的不同的事情，而是说明最终目标是什么并提供给定目标的预期输出。还要添加您的代码，以表明您在询问之前已尝试自己解决问题。

标签： awk text-formatting

【解决方案1】：

rethab 的回答完美地满足了您添加额外列的第一个要求。这满足了您的第二个要求（仅打印少于 4 个零的行）。使用 awk（使用 GNU awk 测试），只需计算字段 5 和字段 9（变量 nz）之间的非零字段，仅在大于或等于 2 时打印：

$ cat foo.txt
chr1 100 110 + 2 3 0 8 6
chr1 150 200 + 1 4 0 2 0
chr1 250 260 + 0 0 0 1 0
chr1 200 220 + 1 4 2 0 0
chr1 250 260 + 4 2 6 1 3
$ awk '{nz=0; for(i=5;i<=9;i++) nz+=($i!=0)} nz>=2' foo.txt
chr1 100 110 + 2 3 0 8 6
chr1 150 200 + 1 4 0 2 0
chr1 200 220 + 1 4 2 0 0
chr1 250 260 + 4 2 6 1 3

【讨论】：

【解决方案2】：

此脚本计算零并将它们附加为最后一列：

awk '{
  cnt=0
  for (i=5;i<=9;i++) {
    cnt+=($i==0)
  }
  print $0, cnt
}' inputs.txt

请注意，$i==0 如果条件为真则为 1，否则为 0。因此，这可以作为计数器的增量。

【讨论】：

【解决方案3】：

您可以使用 gsub 返回每行的替换数量（这里是每个 s 字符串），然后打印数字：

awk '{s=$5$6$7$8$9;x=gsub(/0/,"&",s);print $0, x}' file
chr1 100 110 + 2 3 0 8 6 1
chr1 150 200 + 1 4 0 2 0 2
chr1 200 220 + 1 4 2 0 0 2
chr1 250 260 + 4 2 6 1 3 0

【讨论】：

这将失败，如 10 之类的数字。
这里是to count how many zeros are in columns 5-9 的问题。