更改 .nextflow 文件夹的位置？答案

【问题标题】：change the location of the .nextflow folder?更改 .nextflow 文件夹的位置？
【发布时间】：2022-01-02 02:25:14
【问题描述】：

当我运行 nextflow 时，我得到一个 .nextflow 文件夹，但我找不到更改其位置的方法（即它不是 -work-dir）。如何更改.nextflow 文件夹的位置？

我查看了launchDir，但它似乎是一个只读的隐式变量，不能在 CLI 中被覆盖，此外，--launchDir 选项仅对 k8s 范围有效（参见@987654321 中的原始聊天@)

我正在使用 Nextflow 20.10.0 build 5430。

【问题讨论】：

.nextflow 缓存目录为每个 Nextflow 实例存储诸如 Nextflow CacheDB 和插件（到父存储库的符号链接）之类的东西。我认为没有办法更改此目录的父路径，而无需事先更改目录。我想知道这是否是一个 XY 问题？
（我必须查找“XY 问题”是什么）...我有一个嵌入 nextflow 的应用程序，在单元和集成测试期间，我得到了分散在项目中的 .nextflow 文件夹和测试文件夹；我想控制.nextflow 文件夹的位置以保持整洁

标签： nextflow

【解决方案1】：

保持物品整洁是令人钦佩的。从this comment 看来，唯一的方法（不做疯狂的事情......）是更改到您希望.nextflow 缓存目录存在的目录并指向所有其他选项（即-work-dir，-log等）到一个单独的目录：

如果你想要.nextflow 在目录 A 和管道工作目录 B：
cd A
nextflow run -w B
.nextflow 必须在启动中目录以正确维护执行历史。

【讨论】：