Dockerfile 找不到可执行脚本（没有这样的文件或目录）答案

【问题标题】：Dockerfile cannot find executable script (no such file or directory)Dockerfile 找不到可执行脚本（没有这样的文件或目录）
【发布时间】：2019-10-25 01:36:53
【问题描述】：

我正在编写 Dockerfile 以便为 Web 服务器（更准确地说是闪亮的服务器）创建映像。它工作得很好，但它依赖于一个巨大的数据库文件夹（db/），它没有随包一起分发，所以我想在创建映像时通过在 Dockerfile 中运行相应的脚本来完成所有这些预处理。

我希望这很简单，但我正在努力弄清楚我的文件在图像中的何处。

这个 repo 的结构如下：

Dockerfile
preprocessing_files
configuration_files
app/
    application_files
    db/
        processed_files

这样app/db/ 不存在，而是在运行preprocessing_files 时创建并填充文件。

Dockerfile 如下：

# Install R version 3.6
FROM r-base:3.6.0

# Install Ubuntu packages
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    sudo \
    gdebi-core \
    pandoc \
    pandoc-citeproc \
    libcurl4-gnutls-dev \
    libcairo2-dev/unstable \
    libxml2-dev \
    libxt-dev \
    libssl-dev

# Download and install ShinyServer (latest version)
RUN wget --no-verbose https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/VERSION -O "version.txt" && \
    VERSION=$(cat version.txt)  && \
    wget --no-verbose "https://s3.amazonaws.com/rstudio-shiny-server-os-build/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-$VERSION-amd64.deb" -O ss-latest.deb && \
    gdebi -n ss-latest.deb && \
    rm -f version.txt ss-latest.deb

# Install R packages that are required
RUN R -e "install.packages(c('shiny', 'flexdashboard','rmarkdown','tidyverse','plotly','DT','drc','gridExtra','fitdistrplus'), repos='http://cran.rstudio.com/')"

# Copy configuration files into the Docker image
COPY shiny-server.conf /etc/shiny-server/shiny-server.conf
COPY /app /srv/shiny-server/
COPY /app/db /srv/shiny-server/app/

# Make the ShinyApp available at port 80
EXPOSE 80

CMD ["/usr/bin/shiny-server"]

以上文件运行良好如果 preprocessing_files 提前运行，所以app/application_files 可以成功读取app/db/processed_files。这个脚本如何在 Dockerfile 中运行？对我来说，直观的解决方案就是这样写：

RUN bash -c "preprocessing.sh"

在ADD 指令之前，但之后preprocessing_files 找不到。如果上面的指令写在ADD 和WORKDIR app/ 下面，也会发生同样的错误。我不明白为什么。

【问题讨论】：

标签： docker shiny-server

【解决方案1】：

您无法从 Dockerfile 在主机上执行代码。 RUN 命令在正在构建的容器内执行。你可以：

在 docker 容器内复制 preprocessing_files 并在容器内运行 preprocessing.sh（这会增加容器的大小）
创建一个makefile/build.sh 脚本，在执行docker build 之前启动preprocessing.sh

【讨论】：

第一个建议是解决方案，但这又失败了。不知道我是不是把文件放在了正确的位置，但是如果我COPY preprocessing*/srv/和WORKDIR /srv/之前使用RUN bash -c "preprocessing.sh", the same error appears. Cannot figure out why it is not even found, when the folder used in COPY`和WORKDIR是完全一样的。
我明白了！试试bash preprocessing.sh。 -c 是执行命令，所以bash -c "echo 123" 可以工作。或者你可以RUN ./preprocessing.sh，如果它有可执行权限。
多么尴尬。其实是-c复制粘贴错误，你是对的。
但是我认为您不应该在容器内进行预处理，因为您需要复制容器内预处理脚本的每个依赖项。如果db 是一个依赖项 - 它也需要被复制。即使您稍后从容器中删除数据，图像也不会缩小，它只会将已删除的文件标记为已删除。您可以使用构建阶段来管理它：docs.docker.com/develop/develop-images/multistage-build
@EuGENE 发生在我们最好的人身上；）