如何使用 R markdown 为数据框的每个子集创建不同的报告？

Question

我有一个看起来像这样的数据集

 City   Score   Count   Returns
 Dallas 2.9 61  21
 Phoenix    2.6 52  14
 Milwaukee  1.7 38  7
 Chicago    1.2 95  16
 Phoenix    5.9 96  16
 Dallas 1.9 45  12
 Dallas 2.7 75  45
 Chicago    2.2 75  10
 Milwaukee  2.6 12  2
 Milwaukee  4.5 32  0
 Dallas 1.9 65  12
 Chicago    4.9 95  13
 Chicago    5   45  5
 Phoenix    5.2 43  5

我想使用 R markdown 构建报告；但是，我需要为每个城市建立一个报告。原因是一个城市看不到另一个城市的报告。如何为每个城市构建报告并将其保存为 PDF？

每个报告都需要中位数 Score、平均值 Count 和平均值 Returns。我知道使用 dplyr 我可以简单地使用

finaldat <- dat %>%
            group_by(City) %>%
            summarise(Score = median(Score),
                      Count = mean(Count)  ,
                      Return= mean(Returns))

但挫败感来自为每个City 生成报告。此外，这是数据的子集，而不是完整数据。也就是说，这份报告内容广泛，是结果报告，是系统性的，对每个City没有不同。

Answer 1

看起来 parameterized report 可能是您需要的。有关详细信息，请参阅链接，但基本思想是您在 rmarkdown 报告的 yaml 中设置一个参数，并在报告中使用该参数来自定义它（例如，通过在 City 中过滤数据你的情况）。然后在一个单独的 R 脚本中，您多次 render 报告，对于 City 的每个值一次，您将其作为参数传递给 render 函数。这是一个基本示例：

在您的Rmarkdown 报告中，您将在yaml 中声明参数。如果在呈现报告时没有输入其他值，则列出的值 Dallas 在这种情况下只是默认值：

---
title: My Document
output: pdf_document
params:
   My_City: Dallas
---

然后，在同一个 Rmarkdown 文档中，您将获得整个报告 - 无论计算取决于 City，加上与任何 City 相同的样板文件。您可以使用params$My_City 访问参数。下面的代码会将数据框过滤为My_City参数的当前值：

```{r}
dat %>%        
    filter(City==params$My_City) %>%
    summarise(Score = median(Score),
              Count = mean(Count)  ,
              Return= mean(Returns))
```

然后，在单独的 R 脚本中，您将执行以下操作，为每个 City 生成单独的报告（我假设上面的 Rmarkdown 文件称为 MyReport.Rmd）：

for (i in unique(dat$City)) {
    rmarkdown::render("MyReport.Rmd", 
                      params = list(My_City = i),
                      output_file=paste0(i, ".pdf"))
}

在上面的代码中，我假设dat 数据框位于呈现MyReport.Rmd 的单独R 脚本的全局环境中。但是，您也可以只提供城市名称向量，而不是从 unique(dat$City) 获取名称。

使用动态标题（参见 cmets 中的问题）：

您可以在标题（以及其他 YAML 元数据，例如作者）中使用参数。例如：

rmd 文件

---
title: "Data for `r params$city`"
output: pdf_document
params:
  city: Dallas
---

Body of report

单独的 R 脚本来渲染 rmd 文件

编译两个城市的rmd文件：

for (i in c("New York", "Los Angeles")) {
  rmarkdown::render("test1.Rmd", 
                    params = list(city = i),
                    output_file=paste0(i, ".pdf"))
}

有关更多信息，请参阅R Markdown Cookbook。