在 R 闪亮的应用程序中通过闪亮表输入数据

Question

我想构建一个闪亮的应用程序，它获取矩阵数据作为输入，并根据对它的一些操作返回一个表作为输出。通过搜索，我发现 ShinyTable 包可能很有用。我尝试了下面闪亮的代码，但结果应用程序显示为灰色且没有结果。

library(shinyTable)
shiny::runApp(list(
  ui=pageWithSidebar(
    headerPanel('Simple matrixInput')
    ,
    sidebarPanel(
      htable("tbl")
      ,
      submitButton("OK")
    )
    ,
    mainPanel(

      tableOutput(outputId = 'table.output')
    ))
  ,
  server=function(input, output){
    output$table.output <- renderTable({
      input$tbl^2
    }
    , sanitize.text.function = function(x) x 
    )
  }
))

有什么想法吗？

Answer 1

shinyTable 包在rhandsontable package 中得到了很大改进。

这是一个最小的函数，它接受一个数据框并运行一个闪亮的应用程序，允许对其进行编辑并将其保存在 rds 文件中：

library(rhandsontable)
library(shiny)

editTable <- function(DF, outdir=getwd(), outfilename="table"){
  ui <- shinyUI(fluidPage(

    titlePanel("Edit and save a table"),
    sidebarLayout(
      sidebarPanel(
        helpText("Shiny app based on an example given in the rhandsontable package.", 
                 "Right-click on the table to delete/insert rows.", 
                 "Double-click on a cell to edit"),

        wellPanel(
          h3("Table options"),
          radioButtons("useType", "Use Data Types", c("TRUE", "FALSE"))
        ),
        br(), 

        wellPanel(
          h3("Save"), 
          actionButton("save", "Save table")
        )        

      ),

      mainPanel(

        rHandsontableOutput("hot")

      )
    )
  ))

  server <- shinyServer(function(input, output) {

    values <- reactiveValues()

    ## Handsontable
    observe({
      if (!is.null(input$hot)) {
        DF = hot_to_r(input$hot)
      } else {
        if (is.null(values[["DF"]]))
          DF <- DF
        else
          DF <- values[["DF"]]
      }
      values[["DF"]] <- DF
    })

    output$hot <- renderRHandsontable({
      DF <- values[["DF"]]
      if (!is.null(DF))
        rhandsontable(DF, useTypes = as.logical(input$useType), stretchH = "all")
    })

    ## Save 
    observeEvent(input$save, {
      finalDF <- isolate(values[["DF"]])
      saveRDS(finalDF, file=file.path(outdir, sprintf("%s.rds", outfilename)))
    })

  })

  ## run app 
  runApp(list(ui=ui, server=server))
  return(invisible())
}

例如，取如下数据框：

> ( DF <- data.frame(Value = 1:10, Status = TRUE, Name = LETTERS[1:10],
                    Date = seq(from = Sys.Date(), by = "days", length.out = 10),
                    stringsAsFactors = FALSE) )
   Value Status Name       Date
1      1   TRUE    A 2016-08-15
2      2   TRUE    B 2016-08-16
3      3   TRUE    C 2016-08-17
4      4   TRUE    D 2016-08-18
5      5   TRUE    E 2016-08-19
6      6   TRUE    F 2016-08-20
7      7   TRUE    G 2016-08-21
8      8   TRUE    H 2016-08-22
9      9   TRUE    I 2016-08-23
10    10   TRUE    J 2016-08-24

运行应用程序并享受乐趣（尤其是日历^^）：

编辑handsontable：

点击保存按钮。它将表格保存在文件table.rds 中。然后在 R 中阅读：

> readRDS("table.rds")
   Value Status    Name       Date
1   1000  FALSE Mahmoud 2016-01-01
2   2000  FALSE       B 2016-08-16
3      3  FALSE       C 2016-08-17
4      4   TRUE       D 2016-08-18
5      5   TRUE       E 2016-08-19
6      6   TRUE       F 2016-08-20
7      7   TRUE       G 2016-08-21
8      8   TRUE       H 2016-08-22
9      9   TRUE       I 2016-08-23
10    10   TRUE       J 2016-08-24

Answer 2

如果您正在寻找一种解决方案，用户可以像在 excel 中一样输入他们的矩阵数据，您可能会查看“shinySky”包，更具体地说是它的组件“Handsontable Input/Output”。相关网址为：https://github.com/AnalytixWare/ShinySky。

另一个类似的解决方案是shinyTable 包。您可以在https://github.com/trestletech/shinyTable找到更多信息

Answer 3

您可以使用shinysky package 中的hotable("matrixTable")。

library(shiny, shinysky)
shinyApp(
  ui     = shinyUI (wellPanel(hotable("matrixTable"),hotable("resultTable"))),

  server = shinyServer (function(input, output) {
    A = matrix(c(1:6), nrow=2) # init - input matrix A
    output$matrixTable <- renderHotable({data.frame(A)}, readOnly = FALSE)

    R = matrix(rep(0,6), nrow=2) # init - result matrix R
    output$resultTable <- renderHotable({data.frame(R)}, readOnly = TRUE)

    observe({  # process matrix
      df <- hot.to.df(input$matrixTable)
      if(!is.null(df)) {    # ensure data frame from table exists
        B = data.matrix(df) # ensure its numeric
        R = B^2             # some matrix operation
        output$resultTable <- renderHotable({data.frame(R)})
      }
    }) # end of observe
  }) # end of server
)

在用户界面ui 中，输入"matrixTable" 和"resultTable" 被可视化。 server 初始化这些表，以便可以编辑 matrixTable。这意味着您可以从 Excel 复制和粘贴数据，或手动更改值。每当注意到输入 matrixTable 发生变化时，就会激活 observe 功能。我们从该表中提取带有ho.to.df 的数据框df。如果不是NULL，我们将其转换为矩阵，并应用一些矩阵运算（例如，对每个元素求平方）并将输出作为新矩阵返回。

这个解决方案是通过克里斯托的建议和斯蒂芬的方法得到的。

Answer 4

我不确定以下是否是您要查找的内容，但这里有。假设您可以将矩阵作为文本/csv 文件输入，那么对上面代码的以下修改将起作用。这直接来自 Shiny 教程：http://rstudio.github.io/shiny/tutorial/#uploads

shiny::runApp(list(
    ui=pageWithSidebar(
        headerPanel('Simple matrixInput')
        ,
        sidebarPanel(
            fileInput('file1', 'Choose CSV File',
              accept=c('text/csv', 'text/comma-separated-values,text/plain', '.csv'))
            ,
            tags$hr(),
            checkboxInput('header', 'Header', TRUE),
            radioButtons('sep', 'Separator',
                 c(Comma=',',
                   Semicolon=';',
                   Tab='\t'),
                 'Comma'),
            radioButtons('quote', 'Quote',
                 c(None='',
                   'Double Quote'='"',
                   'Single Quote'="'"),
                 'Double Quote')
        )
        ,
        mainPanel(

            tableOutput(outputId = 'table.output')
        ))
    ,
    server=function(input, output){
        output$table.output <- renderTable({

        inFile <- input$file1

       if (is.null(inFile))
        return(NULL)

        tbl <- read.csv(inFile$datapath, header=input$header, sep=input$sep, quote=input$quote)
        return(tbl^2)
        })
    }
))