如何在 Pybel 中禁用记录的警告？答案

【问题标题】：How to disable logged warnings in Pybel?如何在 Pybel 中禁用记录的警告？
【发布时间】：2018-10-29 08:53:20
【问题描述】：

我正在使用 Pybel - 一个围绕 OpenBabel API 的 Python 包装器，我正在尝试禁用以下警告：

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*** Open Babel Warning  in ParseComplex
  Illegal aromatic element b-

当从 ChEMBL

获取指纹分子 SMILES 时，我的警告一直被提出

【问题讨论】：

【解决方案1】：

您可以从openbabel 模块获取openbabel 记录器（OBMessageHandler 类）的句柄。诀窍是首先从 pybel 模块访问 openbabel 模块，获取 OBMessageHandler 类，然后实例化记录器 (docs)：

import pybel

ob_log_handler = pybel.ob.OBMessageHandler()

使用句柄，您可以将log_level 设置为 0 以禁用除关键消息之外的所有消息 (docs)：

ob_log_handler.SetOutputLevel(0)

您可以使用以下枚举 (docs here) 来选择您的日志记录级别。默认为 1，记录所有警告：

【讨论】：

【解决方案2】：

Aelfinn 的回答对我不起作用，但以这种方式访问 SetOutputLevel 确实有效：

pybel.ob.obErrorLog.SetOutputLevel(0)

【讨论】：

【解决方案3】：

如果你想摆脱所有的错误信息：

pybel.ob.obErrorLog.StopLogging()

【讨论】：