有人用过pubchemdb吗？有没有类似的API？

Question

更新：答案中的链接既有趣又有用，但遗憾的是没有解决对 java API 的需求，所以我仍然期待任何输入。

我正在建立一个化合物数据库。我需要所有同义词（IUPAC 和常用名称）以及每个同义词的安全数据。
我将使用 PubChem (http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/) 上免费提供的数据

有一种简单的方法可以通过简单的 HTTP 获取来查询每个化合物。例如获取甘油数据，URL为：

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=753

以下 URL 将返回一个易于解析的格式：

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=753&disopt=DisplaySDF

但它只会响应非常基本的信息，缺乏安全数据和几个常用名称。

有一个用于 JAVA 的公共领域 API，看起来非常完整，由 Scripps (citation) 的一个小组开发。代码是here。

不幸的是，这个 API 没有很好的文档记录，并且由于所涉及的数据的复杂性而很难遵循。 对于我收集到的信息，pubchemdb 使用的是PubChem Power User Gateway (PUG) XML API

有没有人使用过这个 API（或任何其他可用的 API）？我将不胜感激有关如何开始使用它的简短描述或教程。

Answer 1

Cactvs Chemoinformatics toolkit（学术/教育用途免费）具有完整的 PubChem 集成。使用脚本环境，您可以轻松地执行类似的操作

cactvs>ens 创建 753 ens0 cactvs>ens 获取 ens0 E_NAMESET 丙烷-1,2,3-三醇甘油 8043-29-6 29796-42-7 30049-52-6 37228-54-9 75398-78-6 78630-16-7 8013-25-0 175385-78-1 25618-55-7 64333-26-2 56-81-5 {特勤中号} LS-1377 G8773_SIGMA 15523_RIEDEL {甘油，天然} NCGC00090950-03 191612_ALDRICH 15524_RIEDEL {甘油溶液} L-甘油49767_FLUKA {生物柴油杂质} 49770_FLUKA 49771_FLUKA NCGC00090950- 01 49927_FLUKA甘油 - 明胶G7757_SIAL GOL d-甘油G9012_SIAL {多元醇} c0066 MOON {NSC 9230} G2025_SIGMA ZINC00895048 49781_FLUKA {浓甘油} {浓甘油（JP15）} D00028 {甘油（JP15 / USP）} 44892U_SUPELCO {甘油，浓缩（ JAN）} CRY 49782_FLUKA NCGC00090950-02 G6279_SIAL W252506_ALDRICH G7893_SIAL {甘油，浓缩} 33224_RIEDEL Bulbold水晶Glyceol G9281_SIGMA甘油1,2,3-3H G1901_SIGMA G7043_SIGMA 1,2,3-三羟基-1,2,3- trihydroxypropanol甘油G2289_SIAL G9406_SIGMA { Glycerol-[2-3H]} CHEBI:17754 Glyzerin Oelsuess InChI=1/C3H8O3/c4-1-3(6)2-5/h3-6H,1-2H {90 Technic al glycerine} Dagralax {Glycerin, anhydrous} {Glycerin, synthesis} Glycerine Glyceritol {Glycyl alcohol} Glyrol Glysanin NSC9230 Ophthalgan Osmoglyn Propanetriol {Synthetic glycerin} {Synthetic glycerine} Trihydroxypropane Vitrosupos {WLN: Q1YQ1Q} Glycerol-1,3-14C {4 -01-00-02751（Beilstein 手册参考）} AI3-00091 {BRN 0635685} {CCRIS 2295} {Caswell No. 469} {Citifluor AF 2} {Clyzerin, wasserfrei [德语]} {EINECS 200-289-5} {EPA Pesticide Chemical Code 063507} {FEMA No. 2525} {Glicerina [DCIT]} {Glicerol [INN-Spanish]} {Glycerin (mist)} {Glycerin [JAN]} {Glycerin mist} {Glycerine mist} Glycerinum {Glycerolum [INN-Latin]} Grocolene {HSDB 492} IFP {Incorporation factor} 1,2,3-Propanetriol C00116 Optim {Propanetriol (VAN)} {1,2,3-PROPANETRIOL, HOMOPOLYMER} {Glycerol polymer} {Glycerol,polymers } {HL 80} {PGL 300} {PGL 500} {PGL 700} 聚甘油 聚甘油 聚甘油 {Unigly G 2} {Unigly G 6} G5516_SIGMA MolMap_000024 仙人掌>

这隐藏了所有 PUG 的丑陋 - 但无论如何，我敢说 PUG 有据可查。该工具包远远超出了简单的数据下载 - 如果您愿意，您甚至可以像本地 SD 文件一样打开和查询 PubChem。

不过，PubChem 不包含安全数据。安全数据取决于国家/地区，受到严格监管，您应该非常小心，不要承担责任。让法律人员检查您的方法！