在 R 中，如何根据另一个对象的类设置 S4 类答案

【问题标题】：In R, how do I set an S4 class based on another object's class在 R 中，如何根据另一个对象的类设置 S4 类
【发布时间】：2011-01-22 11:59:32
【问题描述】：

我需要从 Bioconductor 的 ShortRead 库中创建一个 ShortReadQ 类型的对象。

ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality =
          "QualityScore", id = "BStringSet")'

质量槽需要是一个继承自 QualityScore 的对象，我可以很容易地从另一个我希望模拟的 ShortReadQ 对象中确定它。

> class(quality(anotherObject))
[1] "SFastqQuality"
attr(,"package")
[1] "ShortRead"

在构造函数参数中使用该信息（“SFastqQuality”）的最佳方式是什么？

newObject<-ShortReadQ(sread=...,
             quality=SFastqQuality(...), 
             id=...)

【问题讨论】：

我不明白这个问题。您可能想进一步澄清您的问题，或尝试使用 bioconductor 帮助：bioconductor.org/docs/postingGuide.html。
我想获取给定对象的类名并在新对象的构造函数中使用它。最好的方法是什么？

【解决方案1】：

这是你想要的吗？

quality = new(class(old.quality.obj)[[1]]))

【讨论】：

【解决方案2】：

您可能需要 get 函数：

a <- get(class(object))
a(...)

【讨论】：

【解决方案3】：

感谢您的回复。他们引导我找到一个可行的解决方案

newObject<-ShortReadQ(sread=...,
             quality=new(Class=class(quality(anotherObject)),theFirstParameter=...), 
             id=...)

【讨论】：