使用包“minet”的问题 - 找不到函数 mutinformation

Question

在尝试运行 Minet 论文/小插图中的示例代码时，我遇到了很多问题，例如

mim <- build.mim(discretize(syn.data), estimator)

Error in build.mim(dataset, estimator, disc, nbins):
    could not find function "mutinformation"

在尝试以“mi”为前缀的方法时，我还收到了其他错误，例如“未知估算器”。例如“mi.empirical。”

我正在运行 Windows 8.1。任何帮助将不胜感激！

编辑 1：附加信息

在玩了一些之后，我遇到的主要问题是尝试像这样使用 discretize 函数时：

> data(syn.data)
> disc <- "equalwidth"
> nbins <- sqrt(nrow(syn.data))
> ew.data <- discretize(syn.data, disc, nbins)

Error: could not find function "discretize"

这会在所有功能中导致相同的错误，例如利用离散化的 build.mim 或 minet。我可以在不包含离散化的情况下成功运行 build.mim。

此外，如果我将 minet（不包括 discretize 参数）与任何 mi.* 估计方法一起使用，例如

> res<-minet(syn.data,"mrnet","mi.empirical","equal width",10)
Error in build.mim(dataset, estimator, disc, nbins) : 
  could not find function "mutinformation"

但是，使用“spearman”估计器运行相同的函数可以正常工作。

编辑 2：sessionInfo() 的输出

> sessionInfo()
R version 3.1.0 (2014-04-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United Kingdom.1252  LC_CTYPE=English_United Kingdom.1252    LC_MONETARY=English_United Kingdom.1252
[4] LC_NUMERIC=C                            LC_TIME=English_United Kingdom.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] minet_3.20.0

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.1.0

Answer 1

discretize() 是 infotheo 包中的一个函数，您可以在 CRAN 中找到它。在 minet 文档中有一些对该包的引用。也许 minet 的作者已经将一些功能移到 infotheo 包中，但由于它不是依赖项，因此不会自动安装。可能值得就此与作者联系。

library(infotheo)
data(syn.data)
disc <- "equalwidth"
nbins <- sqrt(nrow(syn.data))
ew.data <- discretize(syn.data, disc, nbins)

这同样适用于 multiinformation() 函数()。它是 infotheo 包的一部分。