没有名为“BiocInstaller”的软件包答案

【问题标题】：there is no package called 'BiocInstaller'没有名为“BiocInstaller”的软件包
【发布时间】：2013-11-11 03:42:54
【问题描述】：

每当我尝试安装新软件包时，我都会收到此错误：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")  
Warning in install.packages :  
  package ‘BiocInstaller’ is not available (for R version 3.0.2 RC)  
Installing package into ‘/home/hd-master/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)  
trying URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.13/bioc/src/contrib/BiocInstaller_1.12.0.tar.gz'  
Content type 'application/x-gzip' length 13509 bytes (13 Kb)  
opened URL  
==================================================  
downloaded 13 Kb  

Error in library(BiocInstaller) :   
  there is no package called 'BiocInstaller'  
Execution halted

【问题讨论】：

您是否尝试过打开新的 R 会话并运行命令？如果这不起作用，您可以发布您的sessionInfo()吗？
重装了R，还是一样的问题。
R version 3.0.2 RC (2013-09-17 r63944) 平台：x86_64-unknown-linux-gnu（64 位）语言环境：[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US .UTF-8 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C附加的基础包：[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base 通过命名空间加载（未附加）：[1] tools_3.0.2
这似乎不是 Bioconductor 问题，它适用于我的 R 3.0.2
如果您以空白~/.Rprofile 开头会发生什么？

标签： r rstudio bioconductor

【解决方案1】：

安装 R-3.0.2（不是 RC）。
尝试按如下方式启动 R：R --vanilla
看看你是不是指着一面奇怪的镜子。 getOption("repos") 的输出是什么？
试试这个：install.packages("BiocInstaller", repos="http://bioconductor.org/packages/2.13/bioc")

【讨论】：