【发布时间】:2016-04-18 13:13:11
【问题描述】:
我正在尝试使用 Apache Spark 和 Java 执行矩阵乘法。
我有两个主要问题:
- 如何在 Apache Spark 中创建可以表示矩阵的 RDD?
- 如何将两个这样的 RDD 相乘?
【问题讨论】:
标签: java scala apache-spark rdd apache-spark-mllib
我正在尝试使用 Apache Spark 和 Java 执行矩阵乘法。
我有两个主要问题:
【问题讨论】:
标签: java scala apache-spark rdd apache-spark-mllib
一切都取决于输入数据和维度,但一般来说,您想要的不是RDD,而是来自org.apache.spark.mllib.linalg.distributed 的分布式数据结构之一。目前它提供了DistributedMatrix的四种不同实现方式
IndexedRowMatrix - 可以直接从RDD[IndexedRow] 创建,其中IndexedRow 由行索引和org.apache.spark.mllib.linalg.Vector 组成
import org.apache.spark.mllib.linalg.{Vectors, Matrices}
import org.apache.spark.mllib.linalg.distributed.{IndexedRowMatrix,
IndexedRow}
val rows = sc.parallelize(Seq(
(0L, Array(1.0, 0.0, 0.0)),
(0L, Array(0.0, 1.0, 0.0)),
(0L, Array(0.0, 0.0, 1.0)))
).map{case (i, xs) => IndexedRow(i, Vectors.dense(xs))}
val indexedRowMatrix = new IndexedRowMatrix(rows)
RowMatrix - 类似于IndexedRowMatrix,但没有有意义的行索引。可以直接从RDD[org.apache.spark.mllib.linalg.Vector]创建
import org.apache.spark.mllib.linalg.distributed.RowMatrix
val rowMatrix = new RowMatrix(rows.map(_.vector))
BlockMatrix - 可以从 RDD[((Int, Int), Matrix)] 创建,其中元组的第一个元素包含块的坐标,第二个元素是本地 org.apache.spark.mllib.linalg.Matrix
val eye = Matrices.sparse(
3, 3, Array(0, 1, 2, 3), Array(0, 1, 2), Array(1, 1, 1))
val blocks = sc.parallelize(Seq(
((0, 0), eye), ((1, 1), eye), ((2, 2), eye)))
val blockMatrix = new BlockMatrix(blocks, 3, 3, 9, 9)
CoordinateMatrix - 可以从RDD[MatrixEntry] 创建,其中MatrixEntry 由行、列和值组成。
import org.apache.spark.mllib.linalg.distributed.{CoordinateMatrix,
MatrixEntry}
val entries = sc.parallelize(Seq(
(0, 0, 3.0), (2, 0, -5.0), (3, 2, 1.0),
(4, 1, 6.0), (6, 2, 2.0), (8, 1, 4.0))
).map{case (i, j, v) => MatrixEntry(i, j, v)}
val coordinateMatrix = new CoordinateMatrix(entries, 9, 3)
前两个实现支持乘以本地 Matrix:
val localMatrix = Matrices.dense(3, 2, Array(1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0, 6.0))
indexedRowMatrix.multiply(localMatrix).rows.collect
// Array(IndexedRow(0,[1.0,4.0]), IndexedRow(0,[2.0,5.0]),
// IndexedRow(0,[3.0,6.0]))
并且第三个可以乘以另一个BlockMatrix,只要此矩阵中每个块的列数与另一个矩阵的每个块的行数匹配。 CoordinateMatrix 不支持乘法,但很容易创建和转换为其他类型的分布式矩阵:
blockMatrix.multiply(coordinateMatrix.toBlockMatrix(3, 3))
每种类型都有自己的优势和劣势,当您使用稀疏或密集元素(Vectors 或块Matrices)时,还需要考虑一些额外的因素。乘以局部矩阵通常更可取,因为它不需要昂贵的改组。
您可以在the MLlib Data Types guide 中找到有关每种类型的更多详细信息。
【讨论】:
BlockMatrix 参数有什么用?我还看到 multiply 可以带一个 int 参数?我在尝试将 250k x 30k X 30k x 30k 相乘时遇到问题
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