没有使用 RMySQL 选择数据库答案

【问题标题】：No database selected with RMySQL没有使用 RMySQL 选择数据库
【发布时间】：2016-04-14 09:32:35
【问题描述】：

我正在尝试使用 RMySQL 连接到远程可公开访问的 MySQL 服务器 EnsEMBL 公共服务器，但是当我尝试列出表时，出现错误：

library(RMySQL)

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org')

dbListTables(mydb)

Error in .local(conn, statement, ...) : 
  could not run statement: No database selected

有没有办法查到名字？还是我犯了完全不同的错误？

【问题讨论】：

标签： r rmysql

【解决方案1】：

您必须在 dbConnect 调用中指定数据库的名称。例如：

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org',
                 db = 'homo_sapiens_core_83_38')

dbListTables(mydb)

【讨论】：

谢谢！有没有办法查到名字？我是否必须在他们的网站上找到这个信息，或者我可以通过 R 的查询获得该信息？
此页面上的文件夹名称ftp.ensembl.org/pub/release-83/mysql似乎也是各种数据库的名称
好的，所以我必须事先知道数据库名称。谢谢！

【解决方案2】：

奇怪的是database = 'testdb'在R中执行dbExecute

db <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
        user = 'root',
        password = 'pwd123',
        host = 'localhost',
        database = 'testdb'
      )
dbExecute(db, MySQLStatement) # Executed Without Error

但是当使用dbListTables(db) 时显示没有选择数据库。

将database 更改为db 按预期工作

db <- dbConnect(RMySQL::MySQL(), 
        user = 'root',
        password = 'pwd123',
        host = 'localhost',
        db = 'testdb'
      )

【讨论】：