我正在尝试使用 SBML 包模拟一些模型。模型似乎运行良好，但我不断收到这些警告。 “型号不包含 SBML fbc 包裹信息。 cobrapy 不支持 SBML 包“布局”，未解析信息 cobrapy 不支持 SBML 包“渲染”，未解析信息”
【问题讨论】：
标签： python jupyter-notebook anaconda cobra sbml
您看到的只是警告，您没有使用 SBML fbc 包对基于约束的模型信息进行编码。很可能所有信息（如通量界限和目标函数）都在您的模型中，但采用旧格式（例如 COBRA 格式）。 使用 fbc 将模型更新到 SBML L3 的一种可能方法是使用 cobrapy 导入和导出，即，
from cobra.io import read_sbml_model, write_sbml_model
model = read_sbml_model(input_path)
write_sbml_model(model, output_path)
导出使用最新版本的 fbc。
关于包的警告只是表明相应的信息未在 cobrapy 中使用，即当前既不解析也不在 cobrapy 上下文中使用布局和渲染信息。
StackOverflow 不是解决 cobrapy 相关问题的最佳论坛。最好的帖子问题 https://github.com/opencobra/cobrapy/issues 和上面类似的问题 https://groups.google.com/forum/#!forum/cobra-pie
免责声明：我是 cobrapy SBML 解析器的作者。
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