无法编织 papaja 文件 - 已弃用 pandoc-citeproc 过滤器答案

【问题标题】：Cannot knit papaja file - Deprecated pandoc-citeproc filter无法编织 papaja 文件 - 已弃用 pandoc-citeproc 过滤器
【发布时间】：2021-03-02 16:07:11
【问题描述】：

我无法编织任何 papaja 文件。每当我尝试时，我都会收到此错误：

[警告] 已弃用：pandoc-citeproc 过滤器。请改用 --citeproc。 pandoc-citeproc：$ 中的错误：不兼容的 API 版本：使用 [1,22] 编码，但尝试使用 [1,21] 解码。 CallStack（来自 HasCallStack）：错误，在 pandoc-types-1.21-LpPdBV1sPudK4kVghsVxWs:Text.Pandoc.JSON 中的 ./Text/Pandoc/JSON.hs:112:48 调用运行过滤器 pandoc-citeproc 时出错：过滤器返回错误状态 1 错误：pandoc 文档转换失败，错误 83 执行停止

我正在使用： R 版本 4.0.3 R Studio 版本 1.4.1013 RMarkdown 版本 2.5.3 木瓜版本 0.1.0.9997

我是 R 新手，如果这是一个愚蠢的问题，我很抱歉。

【问题讨论】：

您是否尝试向 Google 询问过这个问题？第一个结果是from RStudio forum。
我确实找到了这个问题，但我已经为此奋斗了好几天。虽然我检查了很多次以查看是否已回答，但自从我上次检查以来，它一定比我想象的要长，因为我看到它现在已被回答。这非常有帮助。谢谢。答案链接到 Github (github.com/crsh/papaja/issues/427#issuecomment-729030996)，我一直试图破译它所说的内容。基本上是说我需要等待它在 papaja 包中修复并且没有解决方法吗？很抱歉有点昏暗，但到最后它变得非常混乱。
我遇到了同样的问题。它很容易复制，至少在我的设置下：使用 papaja 模板制作一个新的 R Markdown 文档，然后尝试编织它。 knitr 编织文档但不产生最终结果，并给出指示的错误消息。用output: pdf_document 替换output: papaja::apa6_pdf 后编织同一个文档不会出错（但不是我们想要的结果）。
我想我们应该耐心等待，它会得到解决。 pajaja 的开发者在 PCS 评论链接的页面上写了 3 天：“我知道这个结果可能会让你感到沮丧，但我很高兴。这意味着问题不在于 papaja 本身（尽管我需要更新软件包以使其与 citeproc 兼容），但使用与 RStudio 预览版一起分发的 pandoc-citeproc 二进制文件。今晚我将尝试传递这个问题。（我也使用 RStudio 预览版。）

标签： papaja

【解决方案1】：

在 2.11 版中，pandoc 已弃用 pandoc-citeproc 过滤器，这给 papaja 所依赖的 rmdfiltr 包的 0.1.2 版带来了一些问题。

应通过安装 rmdfiltr 软件包的 >= 0.1.3 版本来解决该问题，该软件包现在可通过 CRAN 轻松获得

install.packages("rmdfiltr")

【讨论】：

【解决方案2】：

我也遇到了这个问题——相同的 R、RStudio、rmarkdown 和 papaja 版本。补充一下，我使用的是 pandoc 版本 2.11.0.2。

自从这篇文章和后续的 cmets 以来，似乎取得了一些进展。我可以通过安装 rmdfiltr 软件包来编织我的文档：https://github.com/crsh/papaja/issues/427#issuecomment-731730225

remotes::install_github("crsh/rmdfiltr")

【讨论】：