从 Linux 服务器读取存储在 SharePoint 上的 Excel 文件（运行 R Studio）

Question

我正在尝试读取存储在企业 Intranet SharePoint 网站上的 Excel 文件，并且正在使用在使用 Shiny Server 的 Linux 服务器上运行的 R Studio 中的“gdata”包来执行此操作。

我使用 gdata 从 MS Windows 环境中读取文件的结果很好，但在 Linux 服务器上运行脚本时似乎无法正常工作。这是基于以下信息：

http://r.789695.n4.nabble.com/trying-to-import-xls-or-xlsx-files-td3620580.html

我确实修改了 Linux 服务器上 Perl 路径的 R 脚本（与 Windows 上 perl.exe 的路径相比），这似乎工作正常。

文件地址是 "http://sharepoint2/ops/quality/metricspc/Metric OptIn List/temporary SPC Metric Opt-In List.xlsm"

这里是 R 代码：

# R read MS Excel xlsm file from SharePoint
# method using gdata - seems to work with SharePoint 
# NOTE:  requires 'perl' installed
#
# example from
# http://r.789695.n4.nabble.com/trying-to-import-xls-or-xlsx-files-td3620580.html

library(gdata) 

fileurl =   
# see fileurl above this code section - did this due to SO error message about not having 'sharepoint2' in the url

d.optin.init2 <- read.xls(fileurl, 
                          sheet = "OPT-IN LIST", 
                          perl = "/usr/bin/perl")


##### END CODE #####

使用的原始（基于 Windows）脚本perl = "C:\\Perl64\\bin\\perl.exe"

以下是产生的错误消息（在 Shiny Server 上使用 R Studio 从 Linux 运行时）：

d.optin.init2 'http://sharepoint2/ops/quality/metricspc/Metric OptIn List/temporary SPC Metric Opt-In List.xlsm'

download.file(xls, tf, mode = "wb") 中的错误： 打不开网址'http://sharepoint2/ops/quality/metricspc/Metric OptIn List/temporary SPC Metric Opt-In List.xlsm'

另外：警告信息： 在 download.file(xls, tf, mode = "wb") ： 无法打开：HTTP 状态为“400 Bad Request”

file.exists(tfn) 中的错误：'file' 参数无效

文件的路径（在 SharePoint 上）是一个 URL（显示在代码中），所以我认为 Linux 服务器和 MS SharePoint 之间的路由可能很简单。但由于这适用于我的 Windows，但不适用于我的 Linux，我想知道我可能错过了什么？

提前感谢您提供的任何见解。

（我没有附上 Excel 文件，因为我不确定它是否有助于解决这个问题。）

最好的问候，

悬崖

sessionInfo 的输出

会话信息（） R 版本 3.1.0 (2014-04-10) 平台：x86_64-redhat-linux-gnu（64位）

语言环境： 1C

附加的基础包： 1 stats graphics grDevices utils datasets methods base

其他附加包： 1gdata_2.13.3 qcc_2.5

通过命名空间加载（未附加）： 1MASS_7.3-31 gtools_3.4.1 tools_3.1.0

根据 hrbrmstr 和 Greg 提供的建议，我从 Linux 命令行尝试了 wget 和 curl。

wget 结果

卷曲结果

我可以与我们的 IT 人员一起解决问题。如果有人可以帮助我根据这些结果改进我可能向他们提出的问题，我会欢迎您提出意见。

再次感谢那些花时间回复的人。

更多跟进

@Gregory R. Warnes 我可以在 Linux 服务器上通过这个命令行使用 wget：

wget --http-user=myusername --http-passwd=mypassword（把文件地址放在这里）

这似乎访问了文件，弥合了 Linux 服务器和 Windows SharePoint 之间的鸿沟。

现在要弄清楚如何在 gdata R 脚本中包含此 AD 身份验证。

Answer 1

错误信息表明 R 的 download.file() 代码无法访问 URL。

要调试问题，请尝试从 shell 命令行从 Linux 服务器访问该 URL，例如：

如果安装了 wget：

> wget http://sharepoint2/ops/quality/metricspc/Metric OptIn List/temporary SPC Metric Opt-In List.xlsm

或者如果安装了 curl：

> curl http://sharepoint2/ops/quality/metricspc/Metric OptIn List/temporary SPC Metric Opt-In List.xlsm

如果 wget 和/或 curl 生成错误，则说明您存在服务器配置问题。

如果 wget 和/或 curl 成功，那么问题可能出在 R 的 download.file() 上。

-格雷格