NetLogo : nw:save-matrix ordering of the nodes

Question

我正在使用网络扩展在 NetLogo 5.1 中生成不同类型的网络。

我使用 nw:save-matrix 来存储网络的未加权连接矩阵，然后将其加载到 R 中以执行一些更高级的计算。

在这个矩阵中，我想知道哪条线/列对应于哪只海龟。我首先认为顺序只是[谁]的递增顺序（即线/矩阵的第 1 列将简单地对应于具有最低 ID 的海龟）。不幸的是，情况似乎并非如此。

我已经为 nw:set-context 尝试了不同的规范，旨在对网络上下文中的海龟进行排序。例如：

nw:set-context (turtle-set sort turtles)) (link-set sort links)

nw:set-context (turtle-set map [turtle ?] (sort [who] of turtles)) （链接集排序链接）

我什至通过 [who] 明确指定了每只海龟：

nw:set-context (turtle-set (turtle 80) (turtle 117) (turtle 140) (turtle 153) ......

但是这些尝试都没有成功……我还注意到顺序不是随机的。例如，我知道度数最高的节点是海龟 80，但是 nw:save-matrix 生成的矩阵总是对应于第 766 行/列。

这也是链接排序的问题吗？关于 nw:save-matrix 实际工作原理的任何想法？我应该使用另一种策略在 R 中获取这个“有序”连接矩阵吗？

最好的，

Answer 1

目前，没有一致的排序。然而，这不是故意的。我为它创建了一个错误：https://github.com/NetLogo/NW-Extension/issues/151

作为一种解决方法，您实际上可以很容易地自己生成矩阵文件。像这样的东西会做到这一点，尽管它包括所有链接和海龟，而不仅仅是上下文中的那些。如果您使用有限的上下文，应该不会太难调整：

to save-matrix [ filename ]
  if file-exists? filename [ file-delete filename ]
  file-open filename
  let turtle-list sort turtles
  foreach turtle-list [
    let source ?
    foreach turtle-list [
       let target ?
       ifelse [ link-neighbor? target ] of source [
         file-type "1 "
       ] [
         file-type "0 "
       ]
    ]
    file-print ""
  ]
  file-close
end

我没有机会对此进行测试，但它应该可以解决问题。

使用更正的代码进行测试和更新。