在for循环中使用正则表达式复制文件

Question

我有一个包含部分文件名列表的 txt 文件。我只想将 txt 文件中的那些文件复制到另一个目录。但是，我需要使用正则表达式来查找文件。我似乎无法让它正常工作。有什么建议吗？

$ cat file-names.txt

name1    ACTGC
name2    ACTGG
name3    AACTN

$ ls raw/

name1_R1.fastq.gz
name1_R2.txt
name2_R1.fastq.gz
name2_R2.txt
name3_R1.fastq.gz
name4_R2.txt
name5_R1.fastq.gz

$ for i in `cut -f1 file-names.txt` ; do cp raw/"$i"_*.gz ./ ; done

不幸的是，这给出了一个错误：

cp: raw/name1_*.gz: No such file or directory
cp: raw/name2_*.gz: No such file or directory
cp: raw/name3_*.gz: No such file or directory

如何让cp 或rsync 识别* 通配符，而不是将其视为文字文件名？

感谢您的帮助。

Answer 1

给定：

$ ls -1 name{1..5}*
name1_R1.fastq.gz
name1_R2.txt
name2_R1.fastq.gz
name2_R2.txt
name3_R1.fastq.gz
name4_R2.txt
name5_R1.fastq.gz

你可以这样做：

while read -r fn _; do    # no need for cut - shell can split
    ls -1 "${fn}_"*".gz"  # concatenate and expand this way
                          # "$fn"_*.gz works too
    # change to your cp as desired...
done <file-names.txt      # while loop best to loop over file in shell

列表：

name1_R1.fastq.gz
name2_R1.fastq.gz
name3_R1.fastq.gz

---

顺便说一句：

for i in `cut -f1 file-names.txt` ; do ls "$i"_*.gz ; done

在我的电脑上工作。不知道为什么它不在您的计算机上？