在 Python3 中相互创建掩码或边界答案

【问题标题】：Create mask or boundary from each other in Python3在 Python3 中相互创建掩码或边界
【发布时间】：2020-08-06 12:49:52
【问题描述】：

我想从带有边界的图像中获取蒙版，或者从蒙版的图像中获取边界。

这里有两张图片：

我经历了以下，我不明白那里的逻辑： link1、link2、link3、link4

谢谢，伊利亚斯

【问题讨论】：

MASK->CONTOUR：使用带有 RETR_EXTERNAL 的 findContours。 CONTOUR->MASK：使用带有 RETR_TREE 的 findContours，仅使用内部轮廓（使用 contourArea see here），然后使用 drawContours。如果您有特定的编程问题和一些代码，请尝试并回来
@Miki 我不确定您提供的链接中的 c++ 代码。您可以尝试使用 python3 并提供代码吗？我尝试了分水岭等，但我做不到。我想做的事：我想为任何形状（细胞、细胞核等）手工绘制边界。然后，从这些边界创建一个蒙版。或者不画边界，我先手动创建蒙版，然后画边界。
我发现了这个：link。 im = cv.imread('mask.png')im = cv.cvtColor(im,cv.COLOR_BGR2GRAY)idx = cv2.findContours(im,cv2.RETR_EXTERNAL,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)[1][0]out = np.zeros_like(im)out[idx[:,0],idx[:,1]] = 255
但仍然无法创建边界（第二张图像），但如果使用渐变函数，它会给出一些边界但不正确！
现在这个 [link] (docs.opencv.org/3.0-beta/doc/py_tutorials/py_imgproc/…) 帮了大忙：

标签： python-3.x opencv mask scikit-image cv2

【解决方案1】：

从此link 可以使用以下内容；

从掩码中获取边界：

im = cv2.imread('mask.png')
imgray = cv2.cvtColor(im,cv2.COLOR_BGR2GRAY)
ret,thresh = cv2.threshold(imgray,127,255,0)
contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_EXTERNAL,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
tmp = np.zeros_like(im)
boundary = cv2.drawContours(tmp, contours, -1, (255,255,255), 1)
boundary[boundary > 0] = 255
plt.imsave("mask_boundary.png", boundary, cmap = "gray")

【讨论】：

【解决方案2】：

我仍然不明白逻辑，但是，可以从掩码创建边界，从边界创建掩码。

import os
import numpy as np
import cv2
from matplotlib import pyplot as plt

out = "mask_boundary.png"
inp = "mask.png"
im = cv2.imread(inp)
imgray = cv2.cvtColor(im,cv2.COLOR_BGR2GRAY)
ret,thresh = cv2.threshold(imgray,127,255,0)
contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_EXTERNAL,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
tmp = np.zeros_like(im)
boundary = cv2.drawContours(tmp, contours, -1, (255,255,255), 1)
plt.imsave(out, boundary, cmap = "gray")


out = "boundary_mask.png"
inp = "mask_boundary.png"
im = cv2.imread(inp)
imgray = cv2.cvtColor(im,cv2.COLOR_BGR2GRAY)
ret,thresh = cv2.threshold(imgray,0,255,0)
contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
tmp = np.zeros_like(im)
boundary = cv2.drawContours(tmp, contours, 0,(255,255,255), -1)
for i in range(1,len(contours)):
    boundary = cv2.drawContours(boundary, contours, i,(255,255,255), -1)

plt.imsave(out, boundary, cmap = "gray")



out = "boun_mask.png"
inp = "boundary.png"
im = cv2.imread(inp)
imgray = cv2.cvtColor(im,cv2.COLOR_BGR2GRAY)
ret,thresh = cv2.threshold(imgray,0,255,0)
contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
tmp = np.zeros_like(im)
boundary = cv2.drawContours(tmp, contours, 0,(255,255,255), -1)
for i in range(1,len(contours)):
    boundary = cv2.drawContours(boundary, contours, i,(255,255,255), -1)

plt.imsave(out, boundary, cmap = "gray")

注意：使用上面的蒙版图像，我首先创建了边界，然后从这个边界创建了蒙版。但是，我无法将上面的所有边界都转换为遮罩，尤其是图像边缘/边界处的边界。看来边界处也一定有分界线！ 我们将不胜感激！

将上面的掩码转换为边界：

现在将新边界转换为掩码：

现在将上面的边界转换为掩码：

【讨论】：