【发布时间】：2020-09-04 09:23:24
【问题描述】：
我在 Ubuntu 20.04 机器上工作，试图运行一个 R 脚本，该脚本发送带有 mailR 包的 pdf。我已经安装了 Oracle Java 并运行“sudo R CMD javareconf”。这是输出
meteo@BOIRA:~/PROJECTES/SANITAT/TREBALL$ sudo R CMD javareconf
*** JAVA_HOME is not a valid path, ignoring
Java interpreter : /usr/bin/java
Java version : 14.0.1
Java home path : /usr/lib/jvm/java-14-oracle
Java compiler : /usr/bin/javac
Java headers gen.:
Java archive tool: /usr/bin/jar
trying to compile and link a JNI program
detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/include -I$(JAVA_HOME)/include/linux
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -I/usr/lib/jvm/java-14-oracle/include -I/usr/lib/jvm/java-14-oracle/include/linux -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-V28x5H/r-base-3.6.3=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c conftest.c -o conftest.o
gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -o conftest.so conftest.o -L/usr/lib/jvm/java-14-oracle/lib/server -ljvm -L/usr/lib/R/lib -lR
JAVA_HOME : /usr/lib/jvm/java-14-oracle
Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/server
JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/include -I$(JAVA_HOME)/include/linux
JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.
然后我安装了rJava，显然成功了。但是当我尝试加载 mailr 包时，我得到了这个错误：
library(rJava)
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/home/meteo/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/rJava/libs/rJava.so':
libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
但是rJava.so 存在于/home/meteo/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/rJava/libs/
如果我echo $JAVA_HOME 它是空的。我认为 R 没有正确找到 java 但无法弄清楚如何将 R 指向实际的 java 安装，假设 Java 已安装
meteo@BOIRA:~/PROJECTES/SANITAT/TREBALL$ java -version
java version "14.0.1" 2020-04-14
Java(TM) SE Runtime Environment (build 14.0.1+7)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 14.0.1+7, mixed mode, sharing)
任何帮助将不胜感激，在此先感谢。
【问题讨论】：
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试着把
$(JAVA_HOME)/lib/server放在LD_LIBRARY_PATH-export LD_LIBRARY_PATH=${JAVA_HOME}/lib/server:${PATH}上 -
我刚试过，但没用。
标签： java r rjava ubuntu-20.04